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E-GEOD-22206 GSE22206 transcription profiling by array Homo sapiens

Homozygous BUB1B mutation and susceptibility to multi-site gastrointestinal neoplasia

提交 2010年6月7日 ·发布 2010年6月16日 ·更新 2014年5月2日
14
样本数
14
实验数
1
芯片平台
实验描述

We investigated the cause of gastrointestinal neoplasia in a man who developed adenocarcinoma of the ampulla of Vater at the age of 34, followed almost three decades later by adenomatous polyps and invasive adenocarcinomas of both the colon and stomach. Premature chromatid separation, mosaic variegated aneuploidy (MVA), combined with structural chromosome abnormalities were detected in his cells. We identified a homozygous intronic mutation, c.2386-11A>G in BUB1B which creates a de novo splice site that is favored over the authentic site. This study expands the phenotype of BUB1B mutations and MVA to include common adult-onset cancers and provides evidence for the interdependency of APC and BUBR1 proteins in humans. 2 biological replicates of 7 samples (lymphoblastoid cell line (LCL) of the affected proband, fibroblasts of the affected proband, LCLs from 2 relatives of the proband, LCLs from 2 unaffected controls, fibroblasts from 1 control) were processed at the same time.

芯片平台
A-MEXP-931
Illumina HumanRef-8 v2 Expression BeadChip(14 例)
样本属性
cell type
Fibroblasts, Lymphoblastoid cell line
individual
Control, Proband, Relative 1, Relative 2
Organism
Homo sapiens
实验信息
登记号
E-GEOD-22206
GEO 编号
GSE22206
实验类型
transcription profiling by array
物种
Homo sapiens
提交日期
2010年6月7日
发布日期
2010年6月16日
更新日期
2014年5月2日
提交者
Jorge S Reis-Filho、 Tomi Pastinen、 Marc D Tischkowitz、 Yael B Kushner、 Nancy Hamel、 Landon Wark、 William D Foulkes、 Josée Lavoie、 Felipe C Geyer、 Sabine Mai、 Cristian Capelli、 Victoria A Marcus、 David J Novak、 Thomas Rio Frio
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