Arabidopsis cold regulated transcriptome, translatome and CSP1 RNA regulon

·发布 2013年3月31日 ·更新 2014年6月2日

样本数

实验数

芯片平台

实验描述

Transcriptome, translatome, and CSP1 RNA regulon analysis of 25-d-o Arabidopsis rosettes exposed to 12h low temperature (4C) treatment. 38 samples, 3 genotypes (35S:HF-RPL18, 35S:AtCSP1-FH#11, and atcsp1-1), 2 conditions (non-stress and cold), 3 RNA pools (total, polysomal, and CSP1 associated mRNAs), 2-3 biological replicates

芯片平台

A-AFFY-2

Affymetrix GeneChip Arabidopsis Genome [ATH1-121501]（38 例）

样本属性

age

25 days

ecotype

Col-0

ip antibody

None, anti-CSP1

ip antibody vendor

None, Gencript

molecule subtype

CSP1 immonoprecipitated RNA, Polysomal RNA, total RNA

Organism

Arabidopsis thaliana

organism part

rosettes

variation

35S:AtCSP1-FH#11, 35S:HF-RPL18#12-2-4, atcsp1-1

实验信息

登记号

E-GEOD-38030

GEO 编号

GSE38030

实验类型

transcription profiling by array

物种

Arabidopsis thaliana

发布日期

2013年3月31日

更新日期

2014年6月2日

提交者

Julia Bailey-Serres、 Piyada Juntawong、 Piyada Juntawong

外部链接

ArrayExpress 原始页 NCBI GEO：GSE38030

分析服务

Arabidopsis cold regulated transcriptome, translatome and CSP1 RNA regulon

联系地址

微信公众号