E-GEOD-47904
GSE47904
comparative genomic hybridization by ...
Homo sapiens
Somatic point mutation calling in low cellularity tumors
·发布 2014年6月13日
·更新 2014年6月21日
2
样本数
2
实验数
1
芯片平台
实验描述
Illumina 1M Omni Quad arrays were used to test mutation calling accuracy of qSNP tool (a mutation caller) Ilumina array genotypes with GenCal (GC score)>0.70 were used in the comparison of genotype calls using next generation sequencing data and qSNP (mutation caller) 2 samples (control cell line and Melanoma cell line). This is the data for a validation step. contributor: Australian Pancreatic Cancer Genome Initiative
芯片平台
A-GEOD-16573
Illumina HumanOmni1-Quad BeadChip (15004098)（2 例）
样本属性
cell line
COLO-829
cell type
control, melanoma
organism
Homo sapiens
实验信息
登记号
E-GEOD-47904
GEO 编号
GSE47904
实验类型
comparative genomic hybridization by array
物种
Homo sapiens
发布日期
2014年6月13日
更新日期
2014年6月21日
提交者
A V Biankin、
M J Cowley、
D Miller、
S Idrisoglu、
L Finl、
N Waddeell、
O Holmes、
Darrin F Taylor、
A L Johns、
M Pajic、
C Nourse、
J V Pearson、
S M Grimmond、
S Manning、
E Nourbakhsh、
A M Patch、
M Pinese、
M Anderson、
S Song、
C Leonard、
P Wilson、
D Taylor、
K Kassahn、
Q Xu、
S Wani、
A J Gill、
A Christ、
K Nones、
S Wood、
J Wu、
I Harliwong、
F Newell
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