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E-GEOD-53484 SRP034608, GSE53484 RNA-seq of non coding RNA Arabidopsis thaliana

Small RNA profiling in an Arabidopsis transgenic line overexpressing AtmiR472

·发布 2013年12月19日 ·更新 2014年4月15日
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样本数
2
实验数
实验描述

Virus resistance relies in some plant-viral interactions on the RNA-DEPENDANT RNA POLYMERASE 6 (RDR6), a major actor of RNA silencing that acts at the post-transcriptional level. Here, we demonstrate that RDR6 also plays a role in basal defense and race-specific resistance. RDR6 and the microRNA miR472, which target the mRNAs of disease resistance genes of coiled-coil nucleotide-binding leucine-rich-repeats family (e.g. RPS5), act in cooperation to control post-transcriptionally these immune receptors. Induction of these resistance genes is primed in rdr6- and miR472-elicited mutants and this effect is associated with an enhanced basal and race-specific immunity in these backgrounds. Comparison of Col0 WT sRNA with miR472 over-expressor mutant.

样本属性
cultivar
Col-0
genotype
miR472OE, wildtype
organism
Arabidopsis thaliana
organism part
10 day-old seedlings
实验信息
登记号
E-GEOD-53484
GEO 编号
SRP034608, GSE53484
实验类型
RNA-seq of non coding RNA
物种
Arabidopsis thaliana
发布日期
2013年12月19日
更新日期
2014年4月15日
提交者
Vincent Colot、 Alexis Sarazin、 Lione Navarro、 Odon Thiébeauld、 Olivier Voinnet、 Florence Jay、 Martine Boccara、 Alexis Sarazin
分析服务
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