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E-MTAB-7817 ERP114474 ChIP-seq Mus musculus

RING1B calibrated ChIP-seq (cChIPseq) datasets for control mESCs and an Scc1-AID auxin-inducible degron

提交 2018年10月1日 ·发布 2020年1月23日 ·更新 2020年1月23日
12
样本数
12
实验数
1
相关文献
实验描述

We examined 3D chromatin structure in the absence of cohesin (Scc1-AID auxin-inducible degron) and a control line (E14-Tir1) and found that PRC1 core promoter component RING1B was one of the most enriched proteins. Hence, we performed calibrated ChIP-seq experiments on the control (E14-Tir1) and the Scc1-AID mESC lines with a spike in of HEK293 human cells to further study this relationship.

参考文献
Cohesin Disrupts Polycomb-Dependent Chromosome Interactions in Embryonic Stem Cells
James D.P. Rhodes, Angelika Feldmann, Benjam�n Hern�ndez-Rodr�guez, Noelia D�az, Jill M. Brown, Nadezda A. Fursova, Neil P. Blackledge, Praveen Prathapan, Paula Dobrinic, Miles K. Huseyin, Aleksander Szczurek, Kai Kruse, Kim A. Nasmyth, Veronica J. Buckle, Juan M. Vaquerizas, Robert J. Klose
样本属性
cell line
ES-E14 cell
cell type
mouse embryonic stem cell
date of experiment
08.10.2018
developmental stage
embryo
genotype
E14_Scc1_AID, E14_Tir1
organism
Mus musculus
spike in cell line
HEK293 Homo sapiens cells
strain
129Ola
treatment
Auxin treatment for 6 hours
实验信息
登记号
E-MTAB-7817
GEO 编号
ERP114474
实验类型
ChIP-seq
物种
Mus musculus
提交日期
2018年10月1日
发布日期
2020年1月23日
更新日期
2020年1月23日
提交者
Angelika Feldmann、 Robert J. Klose、 Juan M. Vaquerizas、 James D.P. Rhodes
分析服务
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