ABI3基因详情-基因数据库-基因云馆

ABI3 (ABI family member 3)

symbol:: ABI3
locus group:: protein-coding gene
location:: 17q21.32
gene_family:
alias symbol:: NESH|SSH3BP3
alias name:: None
entrez id:: 51225
ensembl gene id:: ENSG00000108798
ucsc gene id:: uc002iop.1
refseq accession:: NM_016428
hgnc_id:: HGNC:29859
approved reserved:: 2004-03-11

17q21.32

ABI3（ABSCISIC ACID INSENSITIVE 3）是一个植物特异性转录因子，属于B3结构域转录因子家族，在种子发育和萌发过程中起关键作用。它主要在种子中表达，调控种子成熟、休眠和萌发相关基因的表达。ABI3通过响应脱落酸（ABA）信号通路来抑制种子过早萌发，促进种子进入休眠状态。其表达产物含有多个功能域，包括B3 DNA结合域、酸性激活域和核定位信号，能够直接结合特定DNA序列调控下游基因。突变会导致种子对ABA不敏感，表现为过早萌发、脱水耐受力下降和贮藏物质积累异常。ABI3与ABI5、FUS3等转录因子共同构成种子发育调控网络，属于LAFL（LEC1、ABI3、FUS3、LEC2）调控网络的核心成员，这个基因家族的共性是都含有B3 DNA结合域，参与植物发育特别是胚胎发生和种子成熟的调控。当ABI3过表达时会导致种子过早进入成熟程序，抑制幼苗生长；而表达降低则会造成种子成熟缺陷，降低休眠程度和贮藏蛋白积累。ABI3功能异常与多种农作物种子质量下降有关，也是改良种子休眠性和抗逆性的重要靶基因。在拟南芥中的研究表明，ABI3还参与调控植物对干旱、盐胁迫等非生物胁迫的响应。

中文English

这个基因编码的衔接蛋白家族的一个成员。含有同源框同源结构域，富含脯氨酸的区域和SRC-同源3（SH3）域这个家族编码蛋白质的成员，并且是ABI / WAVE复合物，调节肌动蛋白聚合的组成部分。所编码的蛋白质抑制肿瘤细胞的异位转移以及细胞迁移。这可以通过与p21的活化激酶的相互作用来完成。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2013年9月提供]

OMIM数据库中对ABI3基因的介绍 Wikipedia数据库中对ABI3基因的介绍

ABI3基因的碱基序列：[NCBI]

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蛋白质序列

1MAELQQLQEF EIPTGREALR GNHSALLRVA DYCEDNYVQA
41TDKRKALEET MAFTTQALAS VAYQVGNLAG HTLRMLDLQG
81
AALRQVEAR VSTLGQMVNM HMEKVARREI GTLATVQRLP
121PGQKVIAPEN LPPLTPYCRR PLNFGCLDDI GHGIKDLSTQ
161L
SRTGTLSR KSIKAPATPA SATLGRPPRI PEPVHLPVVP
201DGRLSAASSA FSLASAGSAE GVGGAPTPKG QAAPPAPPLP
241SS
LDPPPPP AAVEVFQRPP TLEELSPPPP DEELPLPLDL
281PPPPPLDGDE LGLPPPPPGF GPDEPSWVPA SYLEKVVTLY
321PYT
SQKDNE LSFSEGTVIC VTRRYSDGWC EGVSSEGTGF
361FPGNYVEPSC

结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q9P2A4），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

ABI3基因的碱基突变：仅显示部分snp

rs582824 rs593663 rs597882 rs609257 rs612062 rs616338 rs623682 rs627386 rs634370 rs658979 rs659377 rs659829 rs686259 rs687650 rs850526 rs1009571 rs1009572

ABI3基因在不同组织中的表达： [UniProt]

正向引物序列

正向Tm值

反向引物序列

反向Tm值

评分

GGAGAAAGTGGTGACACTG

58

AGTGACACAGATGACAGTG

57

CTGGATGGAGATGAATTGGG

58

TTCTCCAAGTATGAGGCAGG

59

GGAGAAAGTGGTGACACTG

58

GTGACACAGATGACAGTGC

59

CCTGGATGGAGATGAATTGG

58

TCTCCAAGTATGAGGCAGG

59

CTGGATGGAGATGAATTGGG

58

TCTCCAAGTATGAGGCAGG

59

CATACTTGGAGAAAGTGGTGAC

59

GATGACAGTGCCCTCAGAG

60

尚未收录相关数据

ABI3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt] [GenomeNet]

质膜
细胞质
细胞外
高尔基体
囊泡
细胞骨架
内质网
细胞核
内体
溶酶体
线粒体

ABI3基因的本体（GO）信息：

GO库代码

对应的蛋白质

来源代码

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

Q9P2A4 (UniProtKB)

IPI

GO:0005622

Q9P2A4 (UniProtKB)

IDA

GO:0005737

Q9P2A4 (UniProtKB)

IDA

GO:0005737

Q9P2A4 (UniProtKB)

NAS

GO:0006928

Q9P2A4 (UniProtKB)

NAS

GO:0016020

Q9P2A4 (UniProtKB)

IDA

GO:0030027

Q9P2A4 (UniProtKB)

IDA

GO:0030334

Q9P2A4 (UniProtKB)

IDA

GO:0018108

Q9P2A4 (UniProtKB)

IDA

可能调控 ABI3基因的相关microRNA：

hsa-miR-744

String

BioGrid

IntAct

mentha

MINT

加载中…

关联基因	作用方式	资源库来源/分值

疾病名称

关系值

NofPmids

NofSnps

来源

疾病名称	关系值	NofPmids	NofSnps	来源
Thyroid Neoplasm	0.000542884	2	0	BeFree
Neoplasm Metastasis	0.000542884	2	0	BeFree
Carcinoma of lung	0.000271442	1	0	BeFree
Malignant neoplasm of lung	0.000271442	1	0	BeFree
invasive cancer	0.000271442	1	0	BeFree
Tumor Progression	0.000271442	1	0	BeFree
Colon Carcinoma	0.000271442	1	0	BeFree

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基因基本信息

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基因染色体位置

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基因简述

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基因序列

编码蛋白质

编码蛋白质

基因突变

基因突变

基因表达

基因表达

基因引物

基因引物

转录因子

转录因子

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基因相关microRNA

基因相关microRNA

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