ANKEF1 (ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1)

symbol:
ANKEF1
locus group:
protein-coding gene
location:
20p12.2
gene_family:
Ankyrin repeat domain containing|EF-hand domain containing
alias symbol:
FLJ21669|dJ839B4.6
alias name:
None
entrez id:
63926
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ENSG00000132623
ucsc gene id:
uc002wnp.4
refseq accession:
NM_022096
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HGNC:15803
approved reserved:
2001-09-17
20p12.2

ANKEF1(也称为Ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1)是一个编码含有锚蛋白重复序列(ankyrin repeat)和EF-hand结构域的蛋白质的基因。锚蛋白重复序列是一种介导蛋白质相互作用的保守结构域,常见于参与细胞信号转导、细胞骨架组织和转录调控的蛋白质中;EF-hand结构域则通常结合钙离子(Ca²⁺),参与钙信号传导。ANKEF1的生物学功能尚未完全明确,但基于其结构域特征,推测它可能在钙离子依赖性信号通路或蛋白质相互作用中发挥作用,可能涉及细胞运动、增殖或分化等过程。目前关于ANKEF1的研究较少,其具体作用位点尚不清晰,但EF-hand结构域提示其功能可能与细胞内钙浓度变化相关。若ANKEF1发生突变,可能导致其钙结合能力或蛋白质相互作用异常,进而影响相关信号通路,但具体对机体的影响仍需进一步研究。目前尚未明确ANKEF1与特定疾病的直接关联,但锚蛋白重复和EF-hand蛋白家族的成员常与神经退行性疾病、心血管疾病或癌症相关,因此ANKEF1可能在这些领域具有潜在研究价值。ANKEF1属于锚蛋白重复蛋白家族(ankyrin repeat family),该家族的共性是通过锚蛋白重复序列与其他蛋白质结合,参与广泛的细胞过程,如细胞周期调控、炎症反应和离子运输。若ANKEF1过表达,可能干扰钙信号平衡或异常激活下游通路,导致细胞功能紊乱;而表达降低则可能削弱相关信号传导,影响细胞对钙动态的响应。由于研究有限,其对其他基因或功能的间接影响尚不明确。需注意,ANKEF1的中文译名可能存在差异(如“含锚蛋白重复和EF手结构域蛋白1”),但英文术语(ANKEF1或Ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1)为标准名称。

中文English

ANKEF1基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1MALADKRLEN LQIYKVLQCV RNKDKKQIEK LTKLGYPELI
41NYTEPINGLS ALHLASVSND IDMVSFLLDL GAHPDVQDRM
81 GCTPTMRAA ELGHELSMEI LAKAKADMTI VDNEGKGVLF
121YCILPTKRHY RCALIALEHG ADVNNSTYEG KPIFLRACED
161A HDVKDVCL TFLEKGANPN AINSSTGRTA LMEASREGVV
201EIVRGILERG GEVNAFDNDR HHAAHFAAKG GFFDILKLLF
241AY NGDVGLI SINGNTPLHY AAMGGFADCC KYIAQRGCDL
281KWKNLDHKTP RAVAKEGGFK AASKEIRRAE RIANKLARPG
321AKN PNPLWA LRLHDWSVER EAFLREAFAV LDRGDGSISK
361NDFVMVLEER QDYASSEQLA AIAHLHEKTR GGGVNINEFF
401KGTR YLNKS FVLGSYGPKK KEKGMGKKGK KGKFVLPLPI
441CVIPEYAFPR RQDGGPPYYM IETYKNVTDS SRFNRDHPPE
481HPIQD DSVW YIDDSEKVFS NINIITKAGD LASLKKAFES
521GIPVDMKDNY YKTPLMTACA SGNIDVVKFL LEKGANVNAT
561DNFLWT PLH FACHAGQQDI VELLVESGAL IDAASINNST
601PLNRAIESCR LDTVKYLLDI GAKFQLENRK GHSAMDVAKA
641YADYRII DL IKEKLDNLPK PAENQKLKGK TPPILKTEGP
681EIKKEEELLS SIYGVPTTSE GKKVQKGNVV HLNSLITSGY
721TKKVDITF I PRRIWSPEAT TAELIRKREL RRERFTHEVD
761FDDFMMPFQK NITEKARALE AALKT
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: Q9NU02),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
ANKEF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs479039       rs512313       rs514832       rs518364       rs524625       rs535296       rs558493       rs570855       rs575534       rs580664       rs594811       rs596203       rs604452       rs641648       rs652633       rs656111       rs668091      

ANKEF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGCAATCAACTCATCCACAG
59
ATATGCCTCGAACTATTTCCAC
58
AGACTTCCCAGAACACTGC
59
CGATAATGCCGCTTAGTCG
59
CTAATGCAATCAACTCATCCAC
57
TGCCTCGAACTATTTCCAC
57
AGACTTCCCAGAACACTGC
59
GATAATGCCGCTTAGTCGG
58
AGACTTCCCAGAACACTGC
59
ATAATGCCGCTTAGTCGGT
59
CACCACTTCATTATGCTGCC
59
TCCATTTCAGGTCACATCCTC
59
      尚未收录相关数据

ANKEF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ANKEF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q9NU02 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ANKEF1基因的相关microRNA:     

String
BioGrid
mentha
MINT
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

暂无相关文献数据

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