C1orf87 (chromosome 1 open reading frame 87)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
C1orf87
locus group:
protein-coding gene
location:
1p32.1
gene_family:
alias symbol:
MGC34837|CREF
alias name:
carcinoma-related EF-hand protei...
entrez id:
127795
ensembl gene id:
ENSG00000162598
ucsc gene id:
uc001czs.3
refseq accession:
NM_152377
hgnc_id:
HGNC:28547
approved reserved:
2005-05-27

基因染色体位置

基因染色体位置

1p32.1

基因简述

基因简述

C1orf87（Chromosome 1 Open Reading Frame 87）是一个位于人类1号染色体上的基因，目前对其功能的研究相对有限，但已有研究表明它可能在细胞增殖和分化中发挥一定作用。该基因编码的蛋白质尚未完全明确其具体功能，但预测其可能参与细胞内信号传导或与其他蛋白质相互作用。C1orf87的表达水平在某些癌症（如乳腺癌和肺癌）中异常，提示它可能与肿瘤发生或发展相关。若该基因过表达，可能促进细胞异常增殖，而降低表达则可能影响正常细胞功能。目前尚未明确C1orf87是否属于某个特定的基因家族，因此无法提供家族共性信息。突变对该基因的影响尚不明确，但推测可能干扰其正常功能，进而影响相关生物学过程。由于研究较少，C1orf87与疾病的关联仍需进一步探索。未来研究可能揭示其在细胞代谢、免疫调节或其他生理过程中的潜在作用。

中文English

无

OMIM数据库中对C1orf87基因的介绍     Wikipedia数据库中对C1orf87基因的介绍

基因序列

基因序列

C1orf87基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MSSAWKTPRG SDAMPEIMVK IIGSKHFQYL VEKPKIKEND
41SLKTETQTMH QKPMTDNARQ MSRDTPVPIN FTDQQTTDNP
81 DDVKEKKHP ENNQKSENNQ KLLTGANSSR FLDGNIPSQA
121NVHCSSVPTG DQSLSYVHGI PRRKLRDWSL EQMVRGSSDQ
161P EDIGQSPS GTTNEDAFLL ALVRRELKSR PLSSNLLEKL
201QKELKILDPI SSGFLLQSQL SRLFLKHEVP LQLPTVKILC
241QR FSKRGSP EMVNYEKLLW FLNSAASDYP QQNKAAADLR
281KTESHGTHSQ STPPQHSSSQ PEVNRSLLEI LKMALRTTNG
321RLN IDNLNL SFRKEDRSFS GCLPLPKVRA ICGKHGLYLT
361LSLLETLLNH QDLGYQNEIK WQNFVEMLTR ASSDLLSDLP
401TGKN EKKAP APPMEPEVPE MSQSKTEHMK TPEEELQPES
441SPAETSACKD PLKPLKIRPV SQPFVNPAVK NKAEECETWI
481DRFRK LENA LYLCDLSNTG VLEKERARRL IHNYNLIYNL
521SLSPQKIDQA LRRFRSGENM LLEPALRYLK EL
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q8N0U7），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

C1orf87基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs586404       rs587204       rs594463       rs598202       rs601184       rs601724       rs602488       rs602549       rs603566       rs606037       rs607385       rs611812       rs611926       rs616949       rs623415       rs624303       rs626251      

基因表达

基因表达

C1orf87基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACGTGGATAGACAGGTTCAG
59
TTCCTTCTCCAGAACTCCTG
59
CTCTACCTAAGGTCAGGGC
59
GATGGTTAAGCAATGTTTCCAG
58
CCAGAGAACAACCAGAAATCAG
59
TATAGCCCTGACATTGCCA
59
AACTGCAGAAACTGATGGC
59
ACTTCAGGCTCCATTGGAG
59
TGCTTCCTGTGAAGGACTG
60
CTTGAATGTTCAGCAGTCCC
59
CACTTGGATCTCTTACAAAGCA
59
TTCATTCTTCCCTCAGGTCAG
60
ATTCCCAGGAGAAAGCTTAGAG
60
CTGGCCAATATCCTCAGGT
59
TTCATCTCTGGGACTGCTG
59
ACCTCCCTATGCCATTTCAC
60
CTGCAGAAACTGATGGCAG
59
GACTTCAGGCTCCATTGGA
59
CACTTGGATCTCTTACAAAGCA
59
TCATTCTTCCCTCAGGTCAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

C1orf87基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

C1orf87基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 C1orf87基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
BioGrid
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Bipolar Disorder 0.007101096 3 2 GAD
Rheumatoid Arthritis 0.002367032 1 1 GAD
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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