CKAP5 (cytoskeleton associated protein 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CKAP5
locus group:
protein-coding gene
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11p11.2
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approved reserved:
2005-06-01

基因染色体位置

基因染色体位置

11p11.2

基因简述

基因简述

CKAP5（细胞骨架相关蛋白5）是一种微管结合蛋白，属于CKAP（细胞骨架相关蛋白）家族，也被称为ch-TOG（结肠肝肿瘤过度表达基因）。该基因编码的蛋白在细胞分裂过程中发挥关键作用，特别是在纺锤体微管的动态组装和稳定中。CKAP5通过与微管正端结合，促进微管的生长和稳定，确保染色体在细胞分裂时正确分离。CKAP5在细胞周期调控中至关重要，其功能异常可能导致染色体不稳定，进而引发癌症等疾病。研究表明，CKAP5的突变或表达异常与多种癌症相关，包括乳腺癌、结直肠癌和肺癌，其过表达通常与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。CKAP5的降低表达则可能导致细胞分裂缺陷，如纺锤体形成异常或染色体错误分离，进而引发细胞凋亡或基因组不稳定性。CKAP5属于CKAP基因家族，该家族成员通常参与微管动力学调控和细胞骨架组织，共同维持细胞形态、运动和分裂。CKAP5还与EB1、CLASP等其他微管相关蛋白相互作用，共同调节有丝分裂进程。在癌症治疗中，CKAP5被视为潜在靶点，抑制其功能可能干扰肿瘤细胞的增殖能力。此外，CKAP5在神经元发育中也发挥作用，影响轴突生长和突触可塑性。总体而言，CKAP5是细胞分裂和微管动力学的重要调节因子，其功能异常与多种疾病，尤其是癌症密切相关。

中文English

这个基因编码属于TOG / XMAP215家族细胞骨架相关蛋白。该蛋白质的N端半部分包含一个微管结合域和C-末端半部分包含一个里的KXGS基序结合的微管蛋白二聚体。这种蛋白质具有纺锤体形成两个不同的角色;它保护从解聚动粒微管并起着中心体微管组装的重要作用。这种蛋白质可用于与用于定向细胞运动的细胞皮质微管的适当相互作用是必要的。它还在髓鞘碱性蛋白（MBP）mRNA的翻译通过使用异构核核糖（核蛋白）A2，其与MBP关联相互作用的作用。编码不同同种型的可变剪接转录物变体也已确定。 [由RefSeq的，2011年8月提供]

OMIM数据库中对CKAP5基因的介绍     Wikipedia数据库中对CKAP5基因的介绍

基因序列

基因序列

CKAP5基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MGDDSEWLKL PVDQKCEHKL WKARLSGYEE ALKIFQKIKD
41EKSPEWSKFL GLIKKFVTDS NAVVQLKGLE AALVYVENAH
81 VAGKTTGEV VSGVVSKVFN QPKAKAKELG IEICLMYIEI
121EKGEAVQEEL LKGLDNKNPK IIVACIETLR KALSEFGSKI
161I LLKPIIKV LPKLFESREK AVRDEAKLIA VEIYRWIRDA
201LRPPLQNINS VQLKELEEEW VKLPTSAPRP TRFLRSQQEL
241EA KLEQQQS AGGDAEGGGD DGDEVPQIDA YELLEAVEIL
281SKLPKDFYDK IEAKKWQERK EALESVEVLI KNPKLEAGDY
321ADL VKALKK VVGKDTNVML VALAAKCLTG LAVGLRKKFG
361QYAGHVVPTI LEKFKEKKPQ VVQALQEAID AIFLTTTLQN
401ISED VLAVM DNKNPTIKQQ TSLFIARSFR HCTASTLPKS
441LLKPFCAALL KHINDSAPEV RDAAFEALGT ALKVVGEKAV
481NPFLA DVDK LKLDKIKECS EKVELIHGKK AGLAADKKEF
521KPLPGRTAAS GAAGDKDTKD ISAPKPGPLK KAPAAKAGGP
561PKKGKP AAP GGAGNTGTKN KKGLETKEIV EPELSIEVCE
601EKASAVLPPT CIQLLDSSNW KERLACMEEF QKAVELMDRT
641EMPCQAL VR MLAKKPGWKE TNFQVMQMKL HIVALIAQKG
681NFSKTSAQVV LDGLVDKIGD VKCGNNAKEA MTAIAEACML
721PWTAEQVV S MAFSQKNPKN QSETLNWLSN AIKEFGFSGL
761NVKAFISNVK TALAATNPAV RTAAITLLGV MYLYVGPSLR
801MFFEDEKPA LLSQIDAEFE KMQGQSPPAP TRGISKHSTS
841GTDEGEDGDE PDDGSNDVVD LLPRTEISDK ITSELVSKIG
881DKNWKIRKEG LDEVAGIIN DAKFIQPNIG ELPTALKGRL
921NDSNKILVQQ TLNILQQLAV AMGPNIKQHV KNLGIPIITV
961LGDSKNNVRA A ALATVNAW AEQTGMKEWL EGEDLSEELK
1001KENPFLRQEL LGWLAEKLPT LRSTPTDLIL CVPHLYSCLE
1041DRNGDVRKKA QD ALPFFMM HLGYEKMAKA TGKLKPTSKD
1081QVLAMLEKAK VNMPAKPAPP TKATSKPMGG SAPAKFQPAS
1121APAEDCISSS TEP KPDPKK AKAPGLSSKA KSAQGKKMPS
1161KTSLKEDEDK SGPIFIVVPN GKEQRMKDEK GLKVLKWNFT
1201TPRDEYIEQL KTQM SSCVA KWLQDEMFHS DFQHHNKALA
1241VMVDHLESEK EGVIGCLDLI LKWLTLRFFD TNTSVLMKAL
1281EYLKLLFTLL SEEEY HLTE NEASSFIPYL VVKVGEPKDV
1321IRKDVRAILN RMCLVYPASK MFPFIMEGTK SKNSKQRAEC
1361LEELGCLVES YGMNVC QPT PGKALKEIAV HIGDRDNAVR
1401NAALNTIVTV YNVHGDQVFK LIGNLSEKDM SMLEERIKRS
1441AKRPSAAPIK QVEEKPQ RA QNISSNANML RKGPAEDMSS
1481KLNQARSMSG HPEAAQMVRR EFQLDLDEIE NDNGTVRCEM
1521PELVQHKLDD IFEPVLIP E PKIRAVSPHF DDMHSNTAST
1561INFIISQVAS GDINTSIQAL TQIDEVLRQE DKAEAMSGHI
1601DQFLIATFMQ LRLIYNTHM ADEKLEKDEI IKLYSCIIGN
1641MISLFQIESL AREASTGVLK DLMHGLITLM LDSRIEDLEE
1681GQQVIRSVNL LVVKVLEKSD QTNILSALL VLLQDSLLAT
1721ASSPKFSELV MKCLWRMVRL LPDTINSINL DRILLDIHIF
1761MKVFPKEKLK QCKSEFPIRT L KTLLHTLC KLKGPKILDH
1801LTMIDNKNES ELEAHLCRMM KHSMDQTGSK SDKETEKGAS
1841RIDEKSSKAK VNDFLAEIFK KI GSKENTK EGLAELYEYK
1881KKYSDADIEP FLKNSSQFFQ SYVERGLRVI EMEREGKGRI
1921STSTGISPQM EVTCVPTPTS TVS SIGNTN GEEVGPSVYL
1961ERLKILRQRC GLDNTKQDDR PPLTSLLSKP AVPTVASSTD
2001MLHSKLSQLR ESREQHQHSD LDSN QTHSS GTVTSSSSTA
2041NIDDLKKRLE RIKSSRK
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q14008），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

CKAP5基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1007738       rs1037873       rs1130904       rs1319137       rs1380949       rs1551744       rs1585455       rs2035069       rs2867206       rs4075619       rs4076557       rs4128315       rs4237546       rs4264121       rs4281449       rs4294527       rs4382863      

基因表达

基因表达

CKAP5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACACAAGCTGTGGAAAGC
59
CCACTGCATTGGAATCAGTG
60
TTCAAACGGCTTAGAGCAG
58
ATCTCCCATTGTGCTTCCA
59
ATCTTCCTTACTACCACACTACAG
60
ATGTCTGCTGCTTGATGGT
60
CTGCTGAACAGGTTGTGTC
59
TGGCATTTGATAGCCAATTCAG
60
CTCTAAAGCAAAGAGTGCAC
57
AAATAGGCCCGGATTTGTC
58
TATTCCTGAACCCAAGATCCG
60
GTGTTGATGTCACCACTGG
59
CACTTCAACAGGCATCTCC
59
TGTGTTACCTATGGAGGACAC
59
GTATTTCCAGCAGTACAGAACC
59
TTGTGCACTCTTTGCTTTAGAG
60
CTGCTGAACAGGTTGTGTC
59
GCATTTGATAGCCAATTCAGAG
58
TTCCTGAACCCAAGATCCG
59
TTGTGTTGATGTCACCACTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CKAP5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CKAP5基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000086
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TAS
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IDA
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IPI
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Q14008 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14008 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14008 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14008 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14008 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14008 (UniProtKB)
IPI
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Q14008 (UniProtKB)
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GO:0005813
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TAS
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Q14008 (UniProtKB)
TAS
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Q14008 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q14008 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q14008 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q14008 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
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TAS
GO:0007051
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IMP
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TAS
GO:0007067
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IEA
GO:0016020
Q14008 (UniProtKB)
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Q14008 (UniProtKB)
IMP
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Q14008 (UniProtKB)
IDA
GO:0050658
Q14008 (UniProtKB)
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Q14008 (UniProtKB)
IMP
GO:0051301
Q14008 (UniProtKB)
IEA
GO:0000930
Q14008 (UniProtKB)
IDA
GO:0015630
Q14008 (UniProtKB)
ISS
GO:0035371
Q14008 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CKAP5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
BioGrid
IntAct
mentha
MINT
Reactome
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.002367032 1 0 GAD

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