CRNN (cornulin)

symbol:
CRNN
locus group:
protein-coding gene
location:
1q21.3
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
SEP53
alias name:
None
entrez id:
49860
ensembl gene id:
ENSG00000143536
ucsc gene id:
uc001ezx.3
refseq accession:
NM_016190
hgnc_id:
HGNC:1230
approved reserved:
2000-03-15
1q21.3

CRNN(Cornulin)基因编码一种角质化包膜蛋白,主要在上皮细胞(如皮肤、食管、宫颈等复层上皮组织)中表达,属于“ fused gene” S100基因家族。该家族共性为编码钙结合蛋白,参与细胞分化、炎症反应和屏障功能。CRNN的表达产物Cornulin是一种结构性蛋白,通过与角蛋白等成分相互作用,参与上皮细胞终末分化及角质包膜形成,维持上皮屏障完整性。其生物学功能包括保护上皮免受机械损伤、调节水分流失及抵御病原体入侵。主要作用位点为上皮细胞的细胞质,尤其在分化终末层的角质形成细胞中富集。CRNN突变可能导致其蛋白功能异常,与多种上皮相关疾病相关,如食管鳞癌(ESCC)中常见CRNN表达下调,提示其可能作为抑癌基因发挥作用;而CRNN过表达则可能增强上皮屏障功能,但异常高表达可能与某些慢性炎症性疾病(如牛皮癣)的过度角质化有关。若CRNN表达降低,会导致上皮屏障脆弱化,增加致癌物渗透风险,并可能影响其他角质化相关基因(如FLG、IVL)的表达;反之,过表达可能抑制促炎因子(如IL-1β)的释放。目前研究发现CRNN甲基化沉默是食管癌早期诊断的潜在标志物,其与TP53突变存在协同作用。该基因的翻译名称“角膜蛋白”存在争议,部分文献保留英文原名Cornulin以避免混淆。

中文English

这个基因编码的蛋白质,其含有N-末端EF-手结构域和多个串联肽重复的“融合的基因”家族的一个成员。所编码的蛋白质包含两个EF-手钙在其N-末端结合域和两个谷氨酰胺,并在其C末端富含苏氨酸的60个氨基酸重复。这个基因,也被称为鳞状上皮热休克蛋白53,也可以在粘膜/上皮的免疫应答和表皮分化中发挥作用。 [由RefSeq的,2009年1月提供]

CRNN基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1MPQLLQNING IIEAFRRYAR TEGNCTALTR GELKRLLEQE
41FADVIVKPHD PATVDEVLRL LDEDHTGTVE FKEFLVLVFK
81 VAQACFKTL SESAEGACGS QESGSLHSGA SQELGEGQRS
121GTEVGRAGKG QHYEGSSHRQ SQQGSRGQNR PGVQTQGQAT
161G SAWVSSYD RQAESQSQER ISPQIQLSGQ TEQTQKAGEG
201KRNQTTEMRP ERQPQTREQD RAHQTGETVT GSGTQTQAGA
241TQ TVEQDSS HQTGRTSKQT QEATNDQNRG TETHGQGRSQ
281TSQAVTGGHA QIQAGTHTQT PTQTVEQDSS HQTGSTSTQT
321QES TNGQNR GTEIHGQGRS QTSQAVTGGH TQIQAGSHTE
361TVEQDRSQTV SHGGAREQGQ TQTQPGSGQR WMQVSNPEAG
401ETVP GGQAQ TGASTESGRQ EWSSTHPRRC VTEGQGDRQP
441TVVGEEWVDD HSRETVILRL DQGNLHTSVS SAQGQDAAQS
481EEKRG ITAR ELYSYLRSTK P
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: Q9UBG3),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
CRNN基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1923491       rs1923492       rs1923493       rs3215709       rs3753443       rs3753444       rs3753445       rs3753446       rs3829868       rs4240876       rs4240877       rs4285700       rs4614261       rs4845763       rs6587670       rs6681629       rs6695830      

CRNN基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCGATGTGATTGTGAAACC
57
TTGAATTCCACAGTCCCTG
57
CGATGTGATTGTGAAACCC
57
CTTGAATTCCACAGTCCCT
57
CGATGTGATTGTGAAACCC
57
TTGAATTCCACAGTCCCTG
57
      尚未收录相关数据

CRNN基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CRNN基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q9UBG3 (UniProtKB)
NAS
GO:0005737
Q9UBG3 (UniProtKB)
TAS
GO:0009408
Q9UBG3 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q9UBG3 (UniProtKB)
IDA
GO:0016337
Q9UBG3 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9UBG3 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9UBG3 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9UBG3 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CRNN基因的相关microRNA:     

String
BioGrid
IntAct
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Esophageal Neoplasms 0.002909916 3 0 BeFree_GAD
Squamous cell carcinoma 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of esophagus 0.000542884 2 0 BeFree
Esophageal carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
EPIDERMAL DIFFERENTIATION COMPLEX 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Eczema 0.000271442 1 0 BeFree
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Khan A, Al Farid F, Junaid A, Siddique MF, Iqbal A, Siddique MS, Uddin J, Karim HA, Husnain G Sci Rep IF: 4.9 2026-04-15
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Mao L, Kang J, Zou A, Wang X, Guo S, Chen S, Su Y, Ge L, Yang J, Wang X Front Oncol IF: 3.4 None
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Lobo-Silva J, Orge C, Neto APDS, Ribeiro BV, Fávaro RD, da Silva JK, Santos SPO, Nunes S, Moitinho-Junior VS, Barral A, Machado NT, Ramos PIP, Khouri R, Farias LP Front Immunol IF: 7.0 None
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