EFCAB10 (EF-hand calcium binding domain 10)

symbol:
EFCAB10
locus group:
protein-coding gene
location:
7q22.3
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100130771
ensembl gene id:
ENSG00000185055
ucsc gene id:
uc003vdc.5
refseq accession:
NM_001355531
hgnc_id:
HGNC:34531
approved reserved:
2008-09-25
7q22.3

EFCAB10(EF-hand calcium binding domain 10)是一个编码EF-hand钙结合蛋白的基因,属于EF-hand钙结合蛋白家族。这个基因家族的共同特点是含有EF-hand结构域,这是一种能够结合钙离子的保守蛋白结构域,参与细胞内钙信号传导和调控。EFCAB10的具体生物学功能尚未完全明确,但基于其家族特性,它可能参与钙离子依赖性信号通路,调节细胞内的生理过程如肌肉收缩、神经传递、细胞增殖和凋亡等。EFCAB10的表达产物可能通过结合钙离子来影响下游蛋白的活性或与其他分子相互作用,从而调控细胞功能。目前关于EFCAB10的主要作用位点研究较少,但EF-hand蛋白通常广泛分布于细胞质或细胞器中,参与多种细胞活动。如果EFCAB10发生突变,可能会影响其钙离子结合能力或与其他蛋白的相互作用,进而干扰相关信号通路,导致细胞功能异常。虽然EFCAB10与特定疾病的直接关联尚未明确,但EF-hand蛋白家族的异常表达或突变常与心血管疾病、神经退行性疾病和癌症等相关。如果EFCAB10过表达,可能会扰乱细胞内钙平衡,导致信号通路过度激活或抑制,影响细胞稳态;而降低表达则可能削弱钙依赖性调控,影响正常生理功能。EFCAB10作为EF-hand家族成员,其共性包括参与钙信号转导、调节酶活性或细胞骨架动态等。由于研究尚在早期,更多功能及机制有待进一步探索。

中文English

EFCAB10基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1METSSRELQA AEYLEKHQIK EVVSYLTSAL LFFRPEKPKE
41YLISLLERLR IAKVTGVAFP FFMDNSNIVA MFEMMDSSGR
81 GTISFVQYK EALKTLGLCT EDEDLQDDGH KITLDKFKEE
121VNKRMKEI
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: A6NFE3),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
EFCAB10基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs13533       rs818622       rs818623       rs818624       rs860182       rs861761       rs864687       rs865326       rs1706906       rs1706920       rs1706921       rs1706922       rs1706923       rs1706924       rs1706928       rs1721500       rs1721502      

EFCAB10基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAACCCTGGGTCTATGCAC
60
ATCCTCTTGTTCACTTCCTCC
60
GGAGGAAGTGAACAAGAGGA
59
CCAGCTGCAGTTTGATATGAC
60
CCATGCTGAACTGCTAGTC
58
CACAAACACTGTAGTCTCCTG
59
AAACCCTGGGTCTATGCAC
60
ATCCTCTTGTTCACTTCCTCC
60
GAGGAAGTATGTATACATCCAGCT
60
TTACTTCAGTTGGAGCAGCA
60
TGTGCAGTATAAAGAAGCCCT
59
ATGCTTGTAGAGAAGCTGGA
58
AAACCCTGGGTCTATGCAC
60
ATCCTCTTGTTCACTTCCTCC
60
GAGGAAGTATGTATACATCCAGC
58
TACTTCAGTTGGAGCAGCA
59
GTGCAGTATAAAGAAGCCCT
57
ATGCTTGTAGAGAAGCTGG
57
AGGAGGAAGTGAACAAGAGG
59
CAGCTGCAGTTTGATATGACTC
60
      尚未收录相关数据

EFCAB10基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

EFCAB10基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
A6NFE3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
J3KR48 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
J3KR52 (UniProtKB)
IEA

可能调控 EFCAB10基因的相关microRNA:     

String
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

暂无相关文献数据

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