EFCAB6-AS1 (EFCAB6 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
EFCAB6-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
22q13.2
gene_family:
alias symbol:
CITF22-123F2.1
alias name:
None
entrez id:
100874197
ensembl gene id:
ENSG00000223843
ucsc gene id:
uc031rxy.2
refseq accession:
NR_046563
hgnc_id:
HGNC:39999
approved reserved:
2011-04-20

基因染色体位置

基因染色体位置

22q13.2

基因简述

基因简述

EFCAB6-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类染色体22q13.1区域，属于EFCAB6基因的反义链转录本。它不编码蛋白质，但通过调控邻近基因EFCAB6或其他靶基因的表达来发挥生物学功能。EFCAB6-AS1在多种组织中表达，但其具体功能尚未完全阐明。研究表明，lncRNA通常参与表观遗传调控、转录调控、剪接调控等过程，可能通过结合RNA结合蛋白或作为miRNA海绵发挥作用。EFCAB6-AS1属于lncRNA基因家族，这一家族的共性是通过RNA分子本身而非蛋白质产物调控基因表达网络。目前关于EFCAB6-AS1突变的研究较少，但lncRNA的突变或表达异常可能导致其调控功能紊乱，进而影响细胞增殖、分化等过程。有研究发现EFCAB6-AS1在部分癌症中表达异常，提示其可能与肿瘤发生发展相关。当EFCAB6-AS1过表达时，可能通过调控下游信号通路促进或抑制肿瘤进展，具体机制可能涉及细胞周期调控或凋亡途径。降低EFCAB6-AS1表达则可能逆转这些效应。由于lncRNA通常具有组织特异性，EFCAB6-AS1在不同疾病中的作用可能存在差异。目前该基因的研究仍处于早期阶段，需要更多实验验证其精确分子机制和临床意义。

中文English

无

OMIM数据库中对EFCAB6-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对EFCAB6-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

EFCAB6-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

EFCAB6-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs736621       rs738725       rs4333025       rs4585129       rs4823090       rs4823127       rs4994541       rs5763962       rs5764159       rs5764204       rs6006725       rs6519808       rs7285376       rs7285825       rs7286735       rs7287558       rs7288023      

基因表达

基因表达

EFCAB6-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTCTAAGATGGTTTCTCCGT
59
TGTGGAGAAATTCAACCCAG
58
CTTCCAGTCTAAGATGGTTTCTC
59
AGAAATTCAACCCAGCACG
59
CACTTGGAAAGAATCCAATCC
57
AACCATCTTAGACTGGAAGAC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

EFCAB6-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

EFCAB6-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 EFCAB6-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

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基因通路

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