ELK4 (ETS transcription factor ELK4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ELK4
locus group:
protein-coding gene
location:
1q32.1
gene_family:
Helix-turn-helix ETS type domain containing
alias symbol:
SAP1
alias name:
SRF accessory protein 1
entrez id:
2005
ensembl gene id:
ENSG00000158711
ucsc gene id:
uc001hcy.3
refseq accession:
NM_021795
hgnc_id:
HGNC:3326
approved reserved:
1994-12-23

基因染色体位置

基因染色体位置

1q32.1

基因简述

基因简述

ELK4（ETS transcription factor ELK4）属于ETS转录因子家族，该家族成员共享一个保守的DNA结合域（ETS结构域），能够识别并结合特定的DNA序列（GGAA/T核心基序），调控下游基因的转录。ELK4主要通过与血清反应因子（SRF）形成复合物，结合到血清反应元件（SRE）上，参与细胞增殖、分化、凋亡和应激反应的调控。它在MAPK信号通路中起关键作用，可被ERK、JNK等激酶磷酸化激活，进而调控如c-Fos等早期反应基因的表达。ELK4的突变或异常表达可能影响其DNA结合能力或转录活性，导致细胞周期紊乱或肿瘤发生。研究发现，ELK4在某些癌症（如前列腺癌、乳腺癌）中过表达，可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤进展；而敲低ELK4可能抑制肿瘤生长，但同时也可能影响正常细胞的应激响应。此外，ELK4与家族成员ELK1、ELK3（NET/SAP2）功能部分冗余，但各自在组织分布和靶基因选择上存在差异。例如，ELK4在睾丸中高表达，可能与生殖细胞发育相关。该基因的异常还可能与心血管疾病或神经退行性疾病有关，具体机制仍需进一步研究。

中文English

该基因是Ets家族的转录因子和三元复合因子（TCF）亚家族的成员。的TCF亚科的蛋白质通过在启动子结合到血清反应因子和血清效应初探元件形成三元复合物的C-fos的原癌基因。由该基因编码的蛋白质由激酶，MAPK1和MAPK8磷酸化。几个转录变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对ELK4基因的介绍     Wikipedia数据库中对ELK4基因的介绍

基因序列

基因序列

ELK4基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MDSAITLWQF LLQLLQKPQN KHMICWTSND GQFKLLQAEE
41VARLWGIRKN KPNMNYDKLS RALRYYYVKN IIKKVNGQKF
81 VYKFVSYPE ILNMDPMTVG RIEGDCESLN FSEVSSSSKD
121VENGGKDKPP QPGAKTSSRN DYIHSGLYSS FTLNSLNSSN
161V KLFKLIKT ENPAEKLAEK KSPQEPTPSV IKFVTTPSKK
201PPVEPVAATI SIGPSISPSS EETIQALETL VSPKLPSLEA
241PT SASNVMT AFATTPPISS IPPLQEPPRT PSPPLSSHPD
281IDTDIDSVAS QPMELPENLS LEPKDQDSVL LEKDKVNNSS
321RSK KPKGLE LAPTLVITSS DPSPLGILSP SLPTASLTPA
361FFSQTPIILT PSPLLSSIHF WSTLSPVAPL SPARLQGANT
401LFQF PSVLN SHGPFTLSGL DGPSTPGPFS PDLQKT
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: P28324），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

ELK4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs13757       rs1064406       rs1064407       rs2185811       rs2282449       rs2282450       rs2282451       rs2282452       rs2282453       rs2867891       rs2867892       rs3088136       rs3204653       rs3208700       rs3208701       rs3747967       rs3747968      

基因表达

基因表达

ELK4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTATGACAAACTCAGCCGA
57
CACAAACTTCTGACCATTCAC
58
CTTAAGAACTGGCTTTGCAC
58
GCTTTAGTGTAACCTGCCC
59
ATTATGACAAACTCAGCCGA
57
CACAAACTTCTGACCATTCAC
58
TACTCTCAGTCCTGTTGCT
58
TTCAGTACAGAAGGAAACTGG
58
TACTCTCAGTCCTGTTGCT
58
TTCAGTACAGAAGGAAACTGG
58
AAGAACTGGCTTTGCACAC
59
TTGCTTTAGTGTAACCTGCC
59
GCCCACTGGGAATACTGAG
60
TCAGTATGATGGGTGTCTGTG
60
GCCCACTGGGAATACTGAG
60
TCAGTATGATGGGTGTCTGTG
60
TTATGACAAACTCAGCCGAG
58
CACAAACTTCTGACCATTCAC
58
TTATGACAAACTCAGCCGAG
58
CACAAACTTCTGACCATTCAC
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
AR
ELK4
Unknown
18469865
ELK4
FOS
Activation
9734357
ELK4
FOS
Unknown
11846562
ELK4
MCL1
Unknown
21846680
ELK4
NR2C2
Unknown
21126370

基因本体信息

ELK4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ELK4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003700
A0A087X2F7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A0A087X2F7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A087X2F7 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
A0A087X2F7 (UniProtKB)
IEA
GO:0000122
P28324 (UniProtKB)
IMP
GO:0000981
P28324 (UniProtKB)
IBA
GO:0001047
P28324 (UniProtKB)
TAS
GO:0003677
P28324 (UniProtKB)
TAS
GO:0003682
P28324 (UniProtKB)
IDA
GO:0003700
P28324 (UniProtKB)
NAS
GO:0003712
P28324 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P28324 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P28324 (UniProtKB)
IBA
GO:0005654
P28324 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
P28324 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
P28324 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
P28324 (UniProtKB)
IBA
GO:0043565
P28324 (UniProtKB)
IEA
GO:0070932
P28324 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ELK4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
BioGrid
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of prostate 0.001357209 5 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Oral candidiasis 0.000542884 2 0 BeFree
Candidiasis of vagina 0.000542884 2 0 BeFree
Sepsis 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Cutaneous Candidiasis 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

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