GUCY2EP (guanylate cyclase 2E, pseudogene)

symbol:
GUCY2EP
locus group:
pseudogene
location:
11q13.5
gene_family:
Guanylate cyclase receptors
alias symbol:
GC-E
alias name:
None
entrez id:
390226
ensembl gene id:
ENSG00000204529
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_024042
hgnc_id:
HGNC:4690
approved reserved:
1997-12-05
11q13.5

GUCY2EP(也称为鸟苷酸环化酶2E假基因)是一个假基因,属于鸟苷酸环化酶(Guanylate Cyclase, GC)基因家族。假基因通常是由功能基因复制或逆转录而来,但由于突变积累而失去编码功能蛋白的能力。GUCY2EP与功能基因GUCY2C(鸟苷酸环化酶2C)高度相似,后者是一种膜结合型鸟苷酸环化酶,主要表达于肠道上皮细胞,负责感知细菌热稳定肠毒素(STa)并激活环磷酸鸟苷(cGMP)信号通路,从而调节电解质和液体分泌。GUCY2C的突变或异常表达与多种肠道疾病相关,如腹泻、炎症性肠病(IBD)和结直肠癌。然而,GUCY2EP由于缺乏完整的开放阅读框或关键功能域,无法产生功能性蛋白,因此其生物学作用尚不明确。假基因可能通过调控其同源功能基因的表达或作为竞争性内源RNA(ceRNA)影响相关信号通路。目前尚未发现GUCY2EP的过表达或降低表达对机体有明显影响,但假基因的异常调控可能与某些疾病的基因表达紊乱有关。鸟苷酸环化酶家族成员通常通过催化GTP生成cGMP参与细胞信号转导,调控多种生理过程,如血管舒张、神经传导和肠道分泌。GUCY2EP作为该家族的假基因成员,可能保留了部分序列同源性,但缺乏酶活性。研究假基因的功能有助于理解基因组的进化及非编码RNA的调控机制。

中文English

此嗅觉具体鸟苷酸环化酶是哺乳动物嗅觉系统的一部分,并编码在啮齿类动物参与chemosensation的蛋白质。该基因已经成为失活成为假基因是人类和大多数灵长类。 [由RefSeq的,2008年10月提供]

GUCY2EP基因的碱基序列:[NCBI]
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GUCY2EP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs731643       rs731644       rs1806526       rs1806527       rs1806528       rs1815813       rs1893306       rs1893307       rs1941599       rs1941600       rs1941601       rs1941602       rs1941604       rs1941605       rs2096901       rs2120898       rs2155848      

GUCY2EP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATGCCTTGGTATTGCCTC
59
CATGAATTCTGTATGCTGACCT
59
GAAGACAGAAAGGCTGCTC
59
AAATACCCTGGTTCCACAG
57
CTGCTCTGTCAGATGATTCC
58
AAATACCCTGGTTCCACAG
57
GATGGAGTCCACAGGTCAG
60
GTAGCTTTCATCAAGGCTGAG
59
GATGCCTTGGTATTGCCTC
59
ATGAATTCTGTATGCTGACCTG
59
GCTCTGTCAGATGATTCCC
58
AAATACCCTGGTTCCACAG
57
      尚未收录相关数据

GUCY2EP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GUCY2EP基因的本体(GO)信息:

可能调控 GUCY2EP基因的相关microRNA:     

加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.002367032 1 1 GAD
Avellino corneal dystrophy 0.000542884 2 0 BeFree
Retinitis Pigmentosa 0.000271442 1 0 BeFree
Autosomal dominant retinitis pigmentosa 0.000271442 1 0 BeFree
Leber Congenital Amaurosis 0.000271442 1 0 BeFree

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