HEXA-AS1 (HEXA antisense RNA 1)

symbol:
HEXA-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
15q23
gene_family:
alias symbol:
FLJ13315
alias name:
None
entrez id:
80072
ensembl gene id:
ENSG00000260339
ucsc gene id:
uc010ukp.1
refseq accession:
NR_027262
hgnc_id:
HGNC:25810
approved reserved:
2005-10-20
15q23

HEXA-AS1是一个长链非编码RNA(lncRNA)基因,位于人类15号染色体上,与HEXA基因的反义链重叠。HEXA基因编码β-己糖胺酶A的α亚基,该酶参与神经节苷脂GM2的降解,而HEXA-AS1可能通过顺式或反式调控机制影响HEXA的表达。HEXA基因的突变会导致泰-萨克斯病(Tay-Sachs disease),一种严重的溶酶体贮积症,表现为神经退行性变和早夭。HEXA-AS1作为HEXA的反义转录本,可能在调控HEXA基因表达中发挥作用,影响β-己糖胺酶A的活性,进而影响神经节苷脂的代谢。目前关于HEXA-AS1的具体生物学功能尚不完全清楚,但lncRNA通常参与染色质重塑、转录调控、剪接调控等过程。如果HEXA-AS1过表达,可能会干扰HEXA的正常表达,导致β-己糖胺酶A活性异常,可能加剧或减轻泰-萨克斯病的症状,具体效应取决于其调控方向。降低HEXA-AS1表达则可能解除对HEXA的抑制或激活作用,影响酶活性。HEXA-AS1属于lncRNA基因家族,这类RNA不编码蛋白质,但可通过多种机制调控基因表达,包括与DNA、RNA或蛋白质相互作用。HEXA-AS1与HEXA基因的密切关联使其成为研究泰-萨克斯病及其他相关溶酶体疾病的重要靶点,未来可能为疾病治疗提供新思路。

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HEXA-AS1基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1MTGKNVYFQS QLEAFHCLQY ELFPSRLTIN LLVTTHIPFP
41QTKPHIARCV FTESSKILLG LWVQDGECSE IMTGAWSCRA
81 LRRKSRNLF SEQLKIIPKD LHFRNTMLSS CIRNQLGGPF
121LLEVENNERL NYRSGEGRQL
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: Q9H8Q6),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
HEXA-AS1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1800428       rs3743230       rs4777505       rs4777506       rs4777507       rs7170481       rs12904366       rs16956866       rs34496117       rs34736306       rs56104280       rs58016062       rs61731240       rs61732485       rs61747114       rs71133988       rs71397237      

HEXA-AS1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAGCCAAGTTCATAATCAGG
58
AACTGCTCTAAACACTCCC
57
AGAAGCAGAAATTAGATCCCAC
58
TGTAAGAATGCAAGCCTTAGGA
60
AAGCAGAAATTAGATCCCACAG
59
GGTGTAAGAATGCAAGCCT
58
      尚未收录相关数据

HEXA-AS1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HEXA-AS1基因的本体(GO)信息:

可能调控 HEXA-AS1基因的相关microRNA:     

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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