HOMER2P1 (HOMER2 pseudogene 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HOMER2P1
locus group:
pseudogene
location:
14q32.33
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
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entrez id:
317768
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ENSG00000228966
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NG_001019
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HGNC:20336
approved reserved:
2003-01-24

基因染色体位置

基因染色体位置

14q32.33

基因简述

基因简述

HOMER2P1是一个假基因，属于HOMER基因家族。假基因是指与功能基因序列相似但通常由于突变而失去功能的基因。HOMER基因家族的主要成员包括HOMER1、HOMER2和HOMER3，它们编码的蛋白质在突触后密度中起重要作用，参与神经元信号传导、突触可塑性以及钙离子调控等过程。HOMER蛋白通过其EVH1结构域与其他蛋白质相互作用，调节谷氨酸受体（如mGluR）的信号通路，影响学习和记忆等高级神经功能。HOMER2P1作为HOMER2的假基因，可能是在进化过程中通过基因复制产生的，但由于积累的突变（如移码突变、终止密码子提前出现或启动子区域缺失），它不再编码功能性蛋白。假基因通常不直接影响机体功能，但某些情况下可能通过竞争性结合miRNA或转录因子来调控其同源功能基因的表达。目前没有明确证据表明HOMER2P1的突变或表达变化与特定疾病直接相关，但HOMER家族的功能基因（如HOMER1）的异常表达或突变与精神分裂症、阿尔茨海默病等神经精神疾病有关。如果HOMER2P1异常高表达，理论上可能通过竞争性机制干扰HOMER2的正常功能，进而影响突触信号传导，但目前缺乏实验数据支持这一假设。降低HOMER2P1表达可能对机体无明显影响，因为假基因通常不具备关键生物学功能。研究假基因如HOMER2P1有助于理解基因组进化及基因调控网络的复杂性。

中文English

无

OMIM数据库中对HOMER2P1基因的介绍     Wikipedia数据库中对HOMER2P1基因的介绍

基因序列

基因序列

HOMER2P1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HOMER2P1基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

HOMER2P1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACAAGGAACATCTATGGG
57
GTGCTGTTTATGGTCACCT
58
TATGGGATCGTCAGTGTGG
59
TATTCGGTGTGATTGTGCTG
59
TATGGGATCGTCAGTGTGG
59
TATTCGGTGTGATTGTGCT
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

HOMER2P1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HOMER2P1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HOMER2P1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

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疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
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