KLF9 (KLF transcription factor 9)

symbol:
KLF9
locus group:
protein-coding gene
location:
9q21.12
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type|Kruppel-like transcription factors
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
687
ensembl gene id:
ENSG00000119138
ucsc gene id:
uc004aht.4
refseq accession:
NM_001206
hgnc_id:
HGNC:1123
approved reserved:
1994-05-17
9q21.12

KLF9(Krüppel样因子9)属于KLF(Krüppel-like factors)基因家族,这是一类具有锌指结构的转录因子家族,其成员通过结合DNA调控基因表达。KLF家族蛋白通常含有三个串联的C2H2型锌指结构域(一种能结合DNA的蛋白结构),并在细胞分化、增殖及凋亡等生物学过程中发挥关键作用。KLF9主要在中枢神经系统、生殖系统和肝脏中表达,其表达产物通过结合特定DNA序列(如GC盒或CACCC盒)来调控下游靶基因的转录,参与神经发育、激素调节(如甲状腺激素信号通路)以及昼夜节律的维持。KLF9的功能特点包括抑制细胞增殖和促进分化,例如在神经元中它可能通过抑制细胞周期蛋白来阻止异常增殖。突变或表达异常可能导致功能紊乱,如KLF9敲除小鼠表现出海马体发育缺陷和认知障碍,而过表达则可能抑制肿瘤生长(如胶质瘤),但也可能干扰正常组织功能。与疾病的关系上,KLF9表达下调与某些癌症(如乳腺癌、肝癌)的进展相关,而其在阿尔茨海默病中可能因调控tau蛋白磷酸化而受影响。若KLF9过表达,可能增强其对增殖相关基因的抑制,导致细胞周期阻滞,但可能损害组织再生能力;反之,低表达可能解除对癌基因的抑制,促进肿瘤发生。KLF家族共性包括依赖锌指结构结合DNA、参与发育和应激反应,且成员间功能存在冗余或拮抗(如KLF4促增殖而KLF9抑增殖)。专业术语中,"锌指结构"指蛋白质中由锌离子稳定的指状折叠,用于识别特定DNA序列;"转录因子"是调控基因转录的蛋白质。若中文术语不准确,"Krüppel"可保留英文,因直译"无足"易误解。

中文English

由该基因编码的蛋白质是结合位于启动子GC盒元件的转录因子。所编码的蛋白质为单个GC盒的结合抑制mRNA的表达,而结合于串联重复GC盒元素激活转录。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

KLF9基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1MSAAAYMDFV AAQCLVSISN RAAVPEHGVA PDAERLRLPE
41REVTKEHGDP GDTWKDYCTL VTIAKSLLDL NKYRPIQTPS
81 VCSDSLESP DEDMGSDSDV TTESGSSPSH SPEERQDPGS
121APSPLSLLHP GVAAKGKHAS EKRHKCPYSG CGKVYGKSSH
161L KAHYRVHT GERPFPCTWP DCLKKFSRSD ELTRHYRTHT
201GEKQFRCPLC EKRFMRSDHL TKHARRHTEF HPSMIKRSKK
241AL ANAL
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: Q13886),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
KLF9基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs8372       rs13152       rs1056448       rs1056454       rs1832218       rs1832219       rs1888154       rs3739771       rs3780603       rs3780604       rs4745009       rs4745010       rs6560130       rs7020167       rs7024724       rs7029751       rs7034715      

KLF9基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGTGCATACAGGTGAACG
59
TGGTCACTCCTCATGAAGC
59
GAGTGCATACAGGTGAACG
59
CTCATGAAGCGCTTCTCAC
59
GAGTGCATACAGGTGAACG
59
CATGAAGCGCTTCTCACAC
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
HOXA10
KLF9
Repression
KLF9
PDCD5
Activation
KLF9
PGR
Unknown
KLF9
PMAIP1
Repression

KLF9基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KLF9基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
Q13886 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
Q13886 (UniProtKB)
TAS
GO:0003700
Q13886 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
Q13886 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q13886 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q13886 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q13886 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q13886 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q13886 (UniProtKB)
TAS
GO:0007623
Q13886 (UniProtKB)
IEP
GO:0010839
Q13886 (UniProtKB)
IMP
GO:0046872
Q13886 (UniProtKB)
IEA
GO:0071387
Q13886 (UniProtKB)
IDA
GO:0097067
Q13886 (UniProtKB)
IDA

可能调控 KLF9基因的相关microRNA:     

String
BioGrid
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Endometriosis 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Body Weight 0.12 1 0 CTD_human
Thyroid Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Colorectal Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Carcinogenesis 0.001900093 7 0 BeFree
Endometrial Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Glioblastoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of endometrium 0.000814326 3 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Uterine Corpus Cancer 0.000814326 3 0 BeFree
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