LNCAROD (lncRNA activating regulator of DKK1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LNCAROD
locus group:
non-coding RNA
location:
10q21.1
gene_family:
alias symbol:
lnc-MBL2-4|A-ROD
alias name:
Activating Regulator of DKK1
entrez id:
101928687
ensembl gene id:
ENSG00000231131
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_120641
hgnc_id:
HGNC:50913
approved reserved:
2014-07-28

基因染色体位置

基因染色体位置

10q21.1

基因简述

基因简述

LNCAROD（Long Non-Coding RNA Associated with Rod Differentiation）是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于非编码RNA家族中的一员。长链非编码RNA家族是一类长度超过200个核苷酸但不编码蛋白质的RNA分子，它们在基因表达调控、染色质重塑、细胞分化等生物学过程中发挥重要作用。LNCAROD主要在视网膜中表达，特别是在视杆细胞（rod cells）的分化和发育过程中起关键作用。视杆细胞是视网膜中的感光细胞，负责在低光条件下感知光线，对于夜间视觉至关重要。LNCAROD通过调控与视杆细胞分化相关的基因表达网络，确保这些细胞的正常发育和功能。研究表明，LNCAROD的表达水平异常可能与某些视网膜疾病相关，如视网膜色素变性（Retinitis Pigmentosa, RP）或先天性夜盲症。如果LNCAROD表达降低，可能导致视杆细胞分化受阻或功能异常，从而影响视觉功能，尤其是在弱光环境下。相反，如果LNCAROD过表达，可能会干扰其他视网膜细胞的正常发育或功能，导致视网膜结构紊乱或功能失调。此外，LNCAROD可能通过与其他非编码RNA或蛋白质相互作用，参与更广泛的基因调控网络，影响视网膜或其他组织的稳态。目前关于LNCAROD的具体分子机制及其在疾病中的详细作用仍在研究中，但它在视杆细胞分化和视觉功能中的重要性已得到初步证实。未来研究可能会进一步揭示LNCAROD在视网膜疾病中的潜在治疗靶点价值。

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无

OMIM数据库中对LNCAROD基因的介绍     Wikipedia数据库中对LNCAROD基因的介绍

基因序列

基因序列

LNCAROD基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LNCAROD基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

LNCAROD基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LNCAROD基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LNCAROD基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LNCAROD基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

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疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关文献

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Substantial unannotated noncoding transcripts in tumors may transcriptionally regulate cancer-related genes.
He S, Xiong W, Huo J, Lin J, Li J, Zhu H BMC Biol IF: 6.779 2026-01-28

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