NUGGC (nuclear GTPase, germinal center associated)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NUGGC
locus group:
protein-coding gene
location:
8p21.1
gene_family:
alias symbol:
HMFN0672|SLIP-GC
alias name:
speckled-like pattern in the ger...
entrez id:
389643
ensembl gene id:
ENSG00000189233
ucsc gene id:
uc003xgm.4
refseq accession:
NM_001010906
hgnc_id:
HGNC:33550
approved reserved:
2007-07-26

基因染色体位置

基因染色体位置

8p21.1

基因简述

基因简述

NUGGC（Nuclear GTPase, Germinal Center Associated）是一种与生发中心相关的核GTP酶基因，主要参与免疫系统中B细胞的增殖、分化和功能调节。其表达产物属于GTP酶超家族，具有水解GTP的能力，通过调控细胞内的信号传导影响免疫应答。NUGGC在生发中心B细胞中高表达，可能通过影响细胞周期或凋亡相关通路维持B细胞的存活和增殖。该基因的突变可能导致功能异常，与某些B细胞淋巴瘤或自身免疫性疾病相关，例如突变可能破坏GTP酶活性，导致信号传导紊乱，进而促进肿瘤发生或免疫失调。若NUGGC过表达，可能增强B细胞增殖，增加淋巴瘤风险；而表达降低则可能削弱生发中心反应，导致抗体生成不足或免疫缺陷。NUGGC属于GTP酶基因家族，该家族成员普遍通过GTP/GDP结合状态切换参与细胞过程调控（如信号转导、囊泡运输）。家族共性包括保守的GTP结合结构域和酶活性，但各成员在组织分布和功能上存在特异性。目前对NUGGC的研究仍有限，其精确机制及相互作用网络需进一步探索。

中文English

无

OMIM数据库中对NUGGC基因的介绍     Wikipedia数据库中对NUGGC基因的介绍

基因序列

基因序列

NUGGC基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MAETKDVFGQ EPHPVEDDLY KERTRKRRKS DRDQRFRAFP
41SMEQSALKEY EKLESRTRRV LSNTYQKLIQ SVFLDDSIPN
81 GVKYLINRL LALIEKPTVD PIYIALFGST GAGKSSLINA
121IIQQAMFLPV SGESICTSCI VQVSSGCCVQ YEAKIHLLSD
161Q EWREELKN LTKLLHRTEE LSREEADAWN RDEAVEEATW
201KLQMIYGNGA ESKNYEELLR AKPKRKIPTS RVITLKAEEA
241EE LSIKLDP YIRTQRRDWD GEAAEMRIWP LIKHVEVTLP
281KSDLIPEGVV LVDIPGTGDF NSKRDEMWKK TIDKCSVIWV
321ISD IERVSG GQAHEDLLNE SIKACQRGFC RDVALVVTKM
361DKLHLPEYLR ERKAGNQAIQ SQREAVLERN EMIKLQRTRI
401LKEK LKRKL PADFKVLEAS DLVYTVSAQE YWQQALLTEE
441ETEIPKLREY IRKSLLDKKK RTVTKYVTEA FGLLLLTDSF
481NSTQN LPNE HLHMSVLRRF AEEKVELLEK AIAQCFACME
521QPLQEGVRTA RTSYRCILRA CLVRSKGNQG FHQTLKAVCL
561KNGIYA SRT LARIDLNEAL TQPVYDQIDP VFGSIFRTGK
601PTGSALMPHI DAFKQSLQEK MTEIGIRSGW KYDSCKKNFL
641IQEISAI LG GLEDHILRRK RRIYESLTAS VQSDLKLCYE
681EAAQITGKKA CERMKDAIRR GVDRQVAEGM FERAQERMQH
721QFQQLKTG I VEKVKGSITT MLALASSQGD GLYKELADVG
761SEYKEMEKLH RSLREVAENA RLRKGMQEFL LRASPSKAGP
801PGTSL
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q68CJ6），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

NUGGC基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs735880       rs921597       rs971882       rs997549       rs999112       rs1000658       rs1377336       rs1542315       rs1901744       rs1901745       rs1947384       rs1984880       rs2045028       rs2045029       rs2100365       rs2280932       rs2305453      

基因表达

基因表达

NUGGC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAAATCAGATCGAGACCAG
57
CTCCAAAGGAGGTGTATTCC
57
CTGATCCAGGAGATAAGTGC
57
GAGGGACTCGTAGATCCTC
58
CTCAGATCTGGTGTATACAGTC
57
TTAGGGATTTCCGTTTCCTC
57
GAAGGAAATCAGATCGAGACC
58
CAAAGGAGGTGTATTCCTTAAGAG
59
GACAGAAATTGGGATAAGAAGTGG
59
AGGATGGCACTTATCTCCTG
59
AAGAAGGAAATCAGATCGAGAC
58
AAGGAGGTGTATTCCTTAAGAG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

NUGGC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NUGGC基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005525
Q68CJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006974
Q68CJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016446
Q68CJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016607
Q68CJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016787
Q68CJ6 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NUGGC基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Feeling suicidal (finding) 0.002367032 1 1 GAD

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A genome-wide association study of copy number variations with umbilical hernia in swine.
Long Yi, Su Ying, Ai Huashui, Zhang Zhiyan, Yang Bin, Ruan Guorong, Xiao Shijun, Liao Xinjun, Ren Jun, Huang Lusheng, Ding Nengshui Anim Genet IF: 2.2 0000-00-00

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