OCM2 (oncomodulin 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
OCM2
locus group:
protein-coding gene
location:
7q21.3
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
4951
ensembl gene id:
ENSG00000135175
ucsc gene id:
uc003upc.4
refseq accession:
NM_006188
hgnc_id:
HGNC:34396
approved reserved:
2008-10-30

基因染色体位置

基因染色体位置

7q21.3

基因简述

基因简述

OCM2（Oncostatin M Receptor Beta）是细胞因子受体家族的一员，属于IL-6受体家族（也称为gp130受体家族）。这个基因编码的蛋白是Oncostatin M（OSM）的受体β亚基，与gp130共同形成功能性受体复合物，参与细胞信号传导。OCM2主要在免疫细胞、内皮细胞和某些肿瘤细胞中表达，其功能涉及炎症反应、细胞增殖、分化和免疫调节。当OSM与OCM2结合时，会激活JAK-STAT、MAPK和PI3K-AKT等信号通路，影响细胞的生长、存活和分化。OCM2的突变可能导致信号传导异常，与炎症性疾病（如类风湿性关节炎）、纤维化疾病和某些癌症（如乳腺癌、胶质瘤）的发生发展相关。如果OCM2过表达，可能增强炎症反应或促进肿瘤细胞的增殖和迁移；而降低表达则可能削弱免疫应答或抑制肿瘤进展。OCM2所在的IL-6受体家族成员通常共享gp130作为共同信号转导亚基，并通过类似的信号通路调控细胞功能。这一家族的基因在免疫调节、造血和细胞应激反应中发挥关键作用。

中文English

该基因是类似于oncomodulin基因，属于钙调蛋白，??也被称为EF-hand蛋白质超家族的高亲和性钙离子结合蛋白。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对OCM2基因的介绍     Wikipedia数据库中对OCM2基因的介绍

基因序列

基因序列

OCM2基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MSITDVLSAD DIAAALQECQ DPDTFEPQKF FQTSGLSKMS
41ASQVKDVFRF IDNDQSGYLD EEELKFFLQK FESGARELTE
81 SETKSLMAA ADNDGDGKIG AEEFQEMVHS
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: P0CE71），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

OCM2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1859642       rs2894160       rs3060405       rs3757456       rs3998550       rs4729399       rs6962899       rs7780056       rs7789040       rs7789181       rs7796698       rs10231883       rs10248044       rs10251155       rs10277446       rs10277460       rs11489504      

基因表达

基因表达

OCM2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCCAAGATGTCAGCCAGTC
59
ACTTAAGCTCTTCTTCATCCAG
58
CCGAGTCAGAAACCAAGTC
58
TTTCCTGGAATTCCTCTGC
57
ATAGACAACGACCAGAGCG
60
CACTCTCAAACTTCTGGAGG
58
CATAGACAACGACCAGAGC
58
ACTCTCAAACTTCTGGAGGA
58
CGAGTCAGAAACCAAGTCC
58
ATTTCCTGGAATTCCTCTGC
58
CAAGATGTCAGCCAGTCAG
58
ACTTAAGCTCTTCTTCATCCAG
58
CGAGTCAGAAACCAAGTCCT
60
ATTTCCTGGAATTCCTCTGCT
60
AAGATGTCAGCCAGTCAGG
59
ACTTAAGCTCTTCTTCATCCAG
58
ATAGACAACGACCAGAGCG
60
ACTCTCAAACTTCTGGAGGA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

OCM2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

OCM2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
P0CE71 (UniProtKB)
NAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 OCM2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
BioGrid
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Sudden Cardiac Death 0.002367032 1 1 GAD
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Lymphoma, Non-Hodgkin 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Uveal melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree

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NOVEL PROTEINS COMPRISING THE STRAMENOPILE TRIPARTITE MASTIGONEME IN OCHROMONAS DANICA (CHRYSOPHYCEAE)(1).
Yamagishi Takahiro, Motomura Taizo, Nagasato Chikako, Kawai Hiroshi J Phycol IF: 2.8 2016-04-04

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