PIRAT1 (PU.1 (SP1) induced regulator of S100A8 and S100A9 alarmin transcription 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PIRAT1
locus group:
non-coding RNA
location:
2p22.2
gene_family:
alias symbol:
PIRAT
alias name:
PU.1-induced regulator of alarmi...
entrez id:
101929559
ensembl gene id:
ENSG00000237803
ucsc gene id:
uc032njt.2
refseq accession:
NR_110011
hgnc_id:
HGNC:37459
approved reserved:
2009-10-16

基因染色体位置

基因染色体位置

2p22.2

基因简述

基因简述

PIRAT1（也称为ZNF385D）是一个锌指蛋白编码基因，属于ZNF385基因家族。这个基因家族的特点是含有多个C2H2型锌指结构域，这些结构域通常参与DNA或RNA结合，因此在基因表达调控中发挥重要作用。PIRAT1主要在神经系统中表达，特别是在大脑的神经元中，研究表明它可能在神经发育和突触可塑性中起关键作用。PIRAT1的表达产物是一种核蛋白，通过与特定DNA序列结合来调节下游基因的转录，影响神经元的生长、分化和功能维持。突变或异常表达可能导致神经发育障碍或精神疾病，如自闭症谱系障碍和精神分裂症。研究发现，PIRAT1的过表达可能干扰神经元的正常信号传导，导致突触功能异常，而降低表达则可能影响神经元的存活和突触形成。此外，PIRAT1与其他锌指蛋白家族成员（如ZNF385A和ZNF385B）在功能上有一定冗余性，但各自也有独特的调控靶点和生物学作用。ZNF385基因家族的共性在于它们通过锌指结构域参与转录调控，并在神经系统发育和功能维持中扮演重要角色。PIRAT1的异常表达或突变可能通过破坏其靶基因的调控网络，进而影响神经系统的稳态，与多种神经精神疾病的发生发展相关。

中文English

无

OMIM数据库中对PIRAT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对PIRAT1基因的介绍

基因序列

基因序列

PIRAT1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

PIRAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

PIRAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PIRAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PIRAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PIRAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关文献

基因相关文献

暂无相关文献数据

基因相关服务

基因相关服务

基因相关评论

基因相关评论

评论加载中...

登录后即可发表评论 登录 注册

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: [email protected]

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备20007159号-2