RFPL1S (RFPL1 antisense RNA 1)

symbol:
RFPL1S
locus group:
non-coding RNA
location:
22q12.2
gene_family:
alias symbol:
RFPL1-AS|NCRNA00006
alias name:
non-protein coding RNA 6
entrez id:
10740
ensembl gene id:
ENSG00000225465
ucsc gene id:
uc003afm.3
refseq accession:
NR_002727
hgnc_id:
HGNC:9978
approved reserved:
1998-11-04
22q12.2

RFPL1S(Ret Finger Protein Like 1S)属于RFPL基因家族,该家族的特征是含有RING finger结构域,这类结构域通常参与蛋白质-蛋白质相互作用和泛素化过程,可能在调控蛋白质降解、细胞周期和转录调控中发挥作用。RFPL1S的具体功能尚未完全明确,但研究表明它可能在神经发育和精子发生中起重要作用。RFPL1S的表达产物可能参与染色质重塑或转录调控,影响细胞分化过程。该基因的主要作用位点可能集中在细胞核内,与其他蛋白质相互作用以调节基因表达。突变或异常表达可能干扰其功能,导致发育缺陷或生殖功能障碍。例如,RFPL1S的缺失或功能丧失可能影响精子形成,导致男性不育。此外,RFPL1S的异常表达可能与某些神经系统疾病或癌症相关,但具体机制仍需进一步研究。如果RFPL1S过表达,可能扰乱正常的细胞分化或增殖过程,导致发育异常或肿瘤发生;而降低表达可能影响生殖细胞或神经细胞的正常功能。RFPL基因家族的共性包括编码含有RING finger结构域的蛋白质,这些蛋白质通常参与泛素-蛋白酶体系统,调控蛋白质稳定性和功能。家族成员在发育、免疫应答和癌症中可能发挥多样化作用。RFPL1S作为其中一员,可能具有类似的调控功能,但其特异性作用仍需深入探索。

中文English

RFPL1S基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
RFPL1S基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs28250       rs28251       rs67115       rs174718       rs465736       rs1132394       rs2106107       rs3804076       rs5763238       rs5763240       rs5763241       rs6006149       rs6006150       rs6006152       rs7285081       rs7511168       rs9608769      

RFPL1S基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAACTCTAAGAAGCTTTGTGGG
60
TGTCCTGTGATAAACCCGG
59
AGGCCCAAATATCTCTTGAC
57
TTGAACTAGGGAAGTTGCC
57
AGGATGGAGTAGAGATGGG
57
TAATCCCAACACTTTGGGAG
58
GAGGATGGAGTAGAGATGGG
59
AATCCCAACACTTTGGGAG
58
CCCAAATATCTCTTGACTTTGG
57
TTTGAACTAGGGAAGTTGCC
58
AACTCTAAGAAGCTTTGTGGG
58
CTGTCCTGTGATAAACCCG
58
ACTCTAAGAAGCTTTGTGGG
58
CTGTCCTGTGATAAACCCG
58
AGGATGGAGTAGAGATGGG
57
AATCCCAACACTTTGGGAG
58
CCCAAATATCTCTTGACTTTGG
57
TTGAACTAGGGAAGTTGCC
57
      尚未收录相关数据

RFPL1S基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RFPL1S基因的本体(GO)信息:

可能调控 RFPL1S基因的相关microRNA:     

加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mapping lncRNAs onto multilevel mRNA co‑expression modules in autism.
Lee CL, Hu GM, Li YP, Mai TL Transl Psychiatry IF: 7.5 2026-07-13
Duplications on human chromosome 22 reveal a novel Ret Finger Protein-like gene family with sense and endogenous antisense transcripts.
Seroussi E, Kedra D, Pan H Q, Peyrard M, Schwartz C, Scambler P, Donnai D, Roe B A, Dumanski J P Genome Res IF: 6.3 1999-11-22

评论加载中...

登录后即可发表评论 登录 注册

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: [email protected]