RFPL4A (ret finger protein like 4A)

symbol:
RFPL4A
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.42
gene_family:
Ring finger proteins
alias symbol:
RNF210
alias name:
None
entrez id:
342931
ensembl gene id:
ENSG00000223638
ucsc gene id:
uc010yge.3
refseq accession:
NM_001145014
hgnc_id:
HGNC:16449
approved reserved:
2001-09-04
19q13.42

RFPL4A(Ret Finger Protein Like 4A)属于RFPL基因家族,该家族成员通常含有RING(一种锌指结构域,参与蛋白质相互作用和泛素化)和B30.2/SPRY结构域(介导蛋白质相互作用),与细胞增殖、分化和免疫调节等功能相关。RFPL4A的具体生物学功能尚未完全明确,但研究表明它可能在神经发育和精子发生中发挥作用,其表达产物可能参与转录调控或蛋白质降解通路。主要作用位点可能集中在睾丸和大脑等组织。突变或表达异常可能影响生殖系统或神经系统的正常功能,但目前与特定疾病的直接关联证据有限。若RFPL4A过表达,可能干扰细胞周期或蛋白质稳态,导致发育异常;而表达降低可能影响精子发生或神经突触形成。该基因家族(RFPL)的共性包括参与泛素-蛋白酶体系统(一种细胞内蛋白质降解机制)和细胞信号转导,部分成员与遗传性疾病(如智力障碍)相关。需要注意的是,现有研究较少,部分结论基于同家族基因功能推测。专业术语中,RING结构域指“Really Interesting New Gene”域,负责泛素连接酶活性;B30.2/SPRY结构域则常见于免疫相关蛋白。目前“Ret Finger Protein”的中文译名“视网膜指样蛋白”可能存在歧义,建议保留英文原名注释。

中文English

RFPL4A基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1MAEHFKQIIR CPVCLKDLEE AVQLKCGYAC CLQCLNSLQK
41EPDGEGLLCR FCSVVSQKDD IKPKYKLRAL VSIIKELEPK
81 LKSVLTMNP RMRKFQVDMT FDVDTANNYL IISEDLRSFR
121SGDLSQNRKE QAERFDTALC VLGTPRFTSG RHYWEVDVGT
161S QVWDVGVC KESVNRQGKI VLSSEHGFLT VGCREGKVFA
201ASTVPMTPLW VSPQLHRVGI FLDVGMRSIA FYNVSDGCHI
241YT FIEIPVC EPWRPFFAHK RGSQDDQSIL SICSVINPSA
281ASAPVSSEGK
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: A6NLU0),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
RFPL4A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs55664540       rs112543659       rs112626692       rs113243326       rs113539797       rs137983013       rs139399324       rs141578637       rs143505672       rs184113539       rs188848717       rs191501920       rs532239674       rs539795081       rs544161540       rs548925336       rs552457796      

RFPL4A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCCATCATCAAGGAACTAGAG
57
GTCATATCCACTTGAAACTTCC
57
TCCATCATCAAGGAACTAGAGC
59
GTCATATCCACTTGAAACTTCCTC
59
ATCATCAAGGAACTAGAGCCC
59
CGTCATATCCACTTGAAACTTCC
59
      尚未收录相关数据

RFPL4A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RFPL4A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
A6NLU0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RFPL4A基因的相关microRNA:     

String
BioGrid
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Refractory Neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
RFPL4A increases the G1 population and decreases sensitivity to chemotherapy in human colorectal cancer cells.
Naito Atsushi, Yamamoto Hirofumi, Kagawa Yoshinori, Naito Yoko, Okuzaki Daisuke, Otani Keisuke, Iwamoto Yoriko, Maeda Sakae, Kikuta Junichi, Nishikawa Keizo, Uemura Mamoru, Nishimura Junichi, Hata Taishi, Takemasa Ichiro, Mizushima Tsunekazu, Ishii Hideshi, Doki Yuichiro, Mori Masaki, Ishii Masaru J Biol Chem IF: 4.1 2015-05-18

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