RNF11 (ring finger protein 11)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RNF11
locus group:
protein-coding gene
location:
1p32.3
gene_family:
Ring finger proteins
alias symbol:
CGI-123|Sid1669p|MGC51169
alias name:
None
entrez id:
26994
ensembl gene id:
ENSG00000123091
ucsc gene id:
uc001csi.5
refseq accession:
NM_014372
hgnc_id:
HGNC:10056
approved reserved:
2000-01-07

基因染色体位置

基因染色体位置

1p32.3

基因简述

基因简述

RNF11（Ring Finger Protein 11）是一种属于E3泛素连接酶家族的基因，其编码的蛋白质含有RING（Really Interesting New Gene）结构域，该结构域赋予其泛素化功能（泛素化是一种标记蛋白质使其被降解的生化过程）。RNF11通过参与泛素-蛋白酶体系统调控多种信号通路，包括TGF-β（转化生长因子-β）和NF-κB（核因子κB）通路，从而影响细胞增殖、凋亡、免疫反应和炎症过程。RNF11的主要作用位点包括细胞质和细胞核，通过与Smad7（TGF-β信号抑制蛋白）等分子相互作用，负调控TGF-β信号传导，抑制过度炎症反应和纤维化。此外，RNF11还通过抑制NF-κB的激活来调节免疫和炎症反应。RNF11的突变可能导致其泛素化功能异常，进而影响相关信号通路的平衡。例如，RNF11功能丧失可能增强TGF-β或NF-κB信号，促进炎症性疾病、纤维化或肿瘤发生。研究表明，RNF11在多种癌症（如乳腺癌、前列腺癌）中表达异常，可能作为抑癌基因或促癌基因发挥作用，具体取决于癌症类型和微环境。RNF11过表达可能抑制TGF-β和NF-κB信号，减轻炎症但可能促进某些肿瘤的免疫逃逸；而低表达可能导致信号通路过度激活，加剧炎症或纤维化。RNF11属于RING型E3泛素连接酶家族，该家族成员均含有RING结构域，通过泛素化修饰底物蛋白调控其稳定性或功能，参与细胞周期、DNA修复和信号转导等关键过程。RNF11与家族其他成员（如RNF4、RNF168）共享底物识别和泛素化机制，但具有独特的相互作用蛋白和生物学功能。目前，RNF11的某些功能术语如“泛素化修饰”可能被简化为“蛋白标记降解”，但其英文原词ubiquitination更准确。

中文English

由该基因编码的蛋白质中含有RING-H2指基序，这是已知可用于蛋白质 - 蛋白质相互作用重要。该基因的表达已显示由突变型RET蛋白（MEN2A / MEN2B）来诱导。在RET基因的种系突变是已知的负责多发性内分泌腺瘤（MEN）的发展。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对RNF11基因的介绍     Wikipedia数据库中对RNF11基因的介绍

基因序列

基因序列

RNF11基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MGNCLKSPTS DDISLLHESQ SDRASFGEGT EPDQEPPPPY
41QEQVPVPVYH PTPSQTRLAT QLTEEEQIRI AQRIGLIQHL
81 PKGVYDPGR DGSEKKIREC VICMMDFVYG DPIRFLPCMH
121IYHLDCIDDW LMRSFTCPSC MEPVDAALLS SYETN
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q9Y3C5），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

RNF11基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3737060       rs10888719       rs10888720       rs11291170       rs12077069       rs12726879       rs12727157       rs12733244       rs34196647       rs58297941       rs58588211       rs66639090       rs71063019       rs71247595       rs71577266       rs71651179       rs72692291      

基因表达

基因表达

RNF11基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCTTCACGAGTCTCAGTC
59
AAGTCCATCATACAGATCACAC
58
ATGACCCTGGAAGAGATGG
58
AGTCCATCATACAGATCACAC
57
CCATATCAGGAACAAGTTCCAG
58
TTCCTCTTCAGTCAGCTGAG
59
CCATATCAGGAACAAGTTCCAG
58
TCCTCTTCAGTCAGCTGAG
58
CTTCACGAGTCTCAGTCCG
59
CAAAGTCCATCATACAGATCACAC
59
TGACCCTGGAAGAGATGGA
59
AAGTCCATCATACAGATCACAC
58
CCCTGGAAGAGATGGATCAG
59
CAAAGTCCATCATACAGATCACAC
59
CTTCACGAGTCTCAGTCCG
59
AAGTCCATCATACAGATCACAC
58
CCATATCAGGAACAAGTTCCA
57
TCCTCTTCAGTCAGCTGAG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RNF11基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNF11基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000151
Q9Y3C5 (UniProtKB)
IDA
GO:0003677
Q9Y3C5 (UniProtKB)
TAS
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Q9Y3C5 (UniProtKB)
IDA
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Q9Y3C5 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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Q9Y3C5 (UniProtKB)
IPI
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Q9Y3C5 (UniProtKB)
IPI
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Q9Y3C5 (UniProtKB)
IEA
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Q9Y3C5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q9Y3C5 (UniProtKB)
IEA
GO:0042787
Q9Y3C5 (UniProtKB)
IDA
GO:0051865
Q9Y3C5 (UniProtKB)
IDA
GO:0055037
Q9Y3C5 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q9Y3C5 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9Y3C5 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RNF11基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
BioGrid
IntAct
mentha
MINT
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Parkinson Disease 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
Mammary Neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Central neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree

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