RNU5F-1 (RNA, U5F small nuclear 1)

symbol:
RNU5F-1
locus group:
non-coding RNA
location:
1p34.1
gene_family:
Small nuclear RNAs
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
26828
ensembl gene id:
ENSG00000199377
ucsc gene id:
uc031tzg.2
refseq accession:
NR_002753
hgnc_id:
HGNC:10216
approved reserved:
1999-12-14
1p34.1

RNU5F-1(U5 small nuclear RNA auxiliary factor 1)属于U5小核核糖核蛋白(U5 snRNP)复合体的核心组分,参与前体mRNA剪接(pre-mRNA splicing),这是真核生物基因表达中移除内含子、连接外显子的关键步骤。该基因编码的蛋白质与U5 snRNA结合,协助剪接体(spliceosome)识别剪接位点并催化反应。其生物学功能主要体现在维持剪接体结构的稳定性及促进剪接效率上。主要作用位点在细胞核内,与其它snRNP(如U1、U2、U4/U6)协同完成剪接过程。若RNU5F-1发生突变(如错义突变或缺失),可能导致剪接体组装缺陷,引发外显子跳跃(exon skipping)或内含子滞留(intron retention),进而产生异常转录本,影响蛋白质功能。这类剪接异常与脊髓性肌萎缩症(SMA)等神经肌肉疾病及某些癌症(如乳腺癌)相关。该基因属于U5 snRNP特异性蛋白家族,该家族成员均含保守的PRP8结合域(PRP8 interaction domain),负责与剪接体核心蛋白PRP8互作,确保剪接活性。过表达RNU5F-1可能扰乱剪接体平衡,导致非特异性剪接事件增加,而低表达则可能引起广泛剪接障碍,影响细胞增殖或凋亡通路(如p53信号异常)。研究还发现,RNU5F-1与某些病毒(如HIV)的RNA加工存在交叉调控,提示其在病毒感染中或有潜在作用。目前其翻译名"U5小核RNA辅助因子1"为直译,但更常见的英文缩写为U5-116K(基于其分子量116 kDa)。

中文English

注:RNU5F(GeneID 26828)于NCBI的Build 37.2正确注解。其正确的位置是CHR1:45187458..45187573( - )。 [2014年6月17日]

RNU5F-1基因的碱基序列:[NCBI]
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RNU5F-1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3008978       rs4660287       rs9429056       rs10127448       rs10127580       rs10127584       rs10127619       rs10127899       rs10127901       rs11211025       rs11211026       rs11800505       rs34227688       rs35593283       rs55898333       rs56211301       rs56296258      

RNU5F-1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

RNU5F-1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNU5F-1基因的本体(GO)信息:

可能调控 RNU5F-1基因的相关microRNA:     

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
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