RSL24D1 (ribosomal L24 domain containing 1)

symbol:
RSL24D1
locus group:
protein-coding gene
location:
15q21.3
gene_family:
alias symbol:
HRP-L30-iso|L30|RPL24L|RPL24
alias name:
None
entrez id:
51187
ensembl gene id:
ENSG00000137876
ucsc gene id:
uc002acn.4
refseq accession:
NM_016304
hgnc_id:
HGNC:18479
approved reserved:
2002-05-23
15q21.3

RSL24D1(Ribosomal L24 Domain containing 1)是一个编码核糖体蛋白的基因,属于核糖体蛋白L24家族。该基因家族的主要共性是参与核糖体的组装和蛋白质的翻译过程,对维持细胞正常功能至关重要。RSL24D1编码的蛋白是核糖体60S大亚基的组成部分,在核糖体生物合成和蛋白质翻译中发挥关键作用。该基因的表达产物通过与rRNA和其他核糖体蛋白相互作用,帮助稳定核糖体结构并促进翻译的准确性。RSL24D1的主要作用位点是细胞质,尤其在核糖体富集的区域活跃。突变或异常表达可能影响核糖体功能,导致翻译效率下降或错误蛋白合成,进而引发细胞生长异常或凋亡。研究表明,RSL24D1的突变可能与某些发育障碍或癌症相关,因为核糖体功能紊乱会干扰细胞增殖和分化。当RSL24D1过表达时,可能加速蛋白质合成,促进细胞增殖,甚至与肿瘤发生相关;而降低表达则可能导致翻译效率下降,影响细胞正常代谢和生长。此外,RSL24D1的表达水平还可能影响其他核糖体相关基因的表达或功能,因为核糖体蛋白之间通常存在协同调控关系。该基因家族的其他成员(如RPL24)也具有类似功能,共同维持翻译机器的稳定性。总的来说,RSL24D1是细胞基础代谢的核心基因之一,其表达异常可能对机体产生广泛影响,尤其在快速增殖的组织或疾病状态下更为显著。

中文English

这个基因编码的蛋白质共享与人核糖体蛋白L24的序列相似性水平低。虽然这个基因被称为RPL24,L30和60S核糖体蛋白L30 isolog在序列数据库,它是从正式命名RPL24人类基因(这本身已经被称为核糖体蛋白L30)和RPL30不同。由该基因编码的蛋白质定位于核仁和被认为起到60S核糖体亚基的生物合成的作用。该基因的确切功能目前未知。该基因利用替代多聚腺苷酸信号,并有多个假。 [由RefSeq的,2012年7月提供]

RSL24D1基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1MRIEKCYFCS GPIYPGHGMM FVRNDCKVFR FCKSKCHKNF
41KKKRNPRKVR WTKAFRKAAG KELTVDNSFE FEKRRNEPIK
81 YQRELWNKT IDAMKRVEEI KQKRQAKFIM NRLKKNKELQ
121KVQDIKEVKQ NIHLIRAPLA GKGKQLEEKM VQQLQEDVDM
161E DAP
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: Q9UHA3),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
RSL24D1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9300       rs13733       rs2277595       rs3759863       rs3809539       rs3809540       rs7179785       rs8042411       rs8043029       rs10518804       rs11540389       rs11855490       rs11857087       rs13380400       rs16976149       rs17856255       rs28393427      

RSL24D1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACGATTGCAAGGTGTTCAG
60
CCACCTAACTTTGCGAGGA
60
TTAAGTTACTGCAGGTGTTCAG
59
CCTAACTTTGCGAGGATTGC
60
GCATCTGGTCTAACAGACC
58
AAATCTGAACACCTTCTTCCC
58
GTGTAGAGGTTGATGGAAGTG
59
AAAGATCAAGATCTGACTGCAG
59
AACGATTGCAAGGTGTTCAG
60
CCACCTAACTTTGCGAGGA
60
CTTGGATGTCTGATGCTTGTC
59
AAATCAATACCCAGGTCTTGAC
59
GAATCTTGGATGTCTGATGCT
58
CAATACCCAGGTCTTGACAG
58
TAAGCTTCTCAAGGTGTTCAG
58
CTAACTTTGCGAGGATTGC
57
ACGATTGCAAGGTGTTCAG
59
CCACCTAACTTTGCGAGGA
60
TAAGTTACTGCAGGTGTTCAG
58
CTAACTTTGCGAGGATTGC
57
      尚未收录相关数据

RSL24D1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RSL24D1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0042254
H3BMQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0003735
H3BPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005840
H3BPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006412
H3BPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0042254
H3BPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0000027
Q9UHA3 (UniProtKB)
IBA
GO:0003735
Q9UHA3 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
Q9UHA3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UHA3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UHA3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UHA3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9UHA3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9UHA3 (UniProtKB)
IDA
GO:0006412
Q9UHA3 (UniProtKB)
IBA
GO:0022625
Q9UHA3 (UniProtKB)
IBA
GO:1902626
Q9UHA3 (UniProtKB)
IBA

可能调控 RSL24D1基因的相关microRNA:     

String
BioGrid
IntAct
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Blood pressure finding 0.002367032 1 1 GAD
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 1 GAD
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Cancer Cell Growth 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000271442 1 0 BeFree
Genetic loci associated with renal function measures and chronic kidney disease in children: the Pediatric Investigation for Genetic Factors Linked with Renal Progression Consortium.
Wuttke Matthias, Wong Craig S, Wühl Elke, Epting Daniel, Luo Li, Hoppmann Anselm, Doyon Anke, Li Yong, , Sözeri Betül, Thurn Daniela, Helmstädter Martin, Huber Tobias B, Blydt-Hansen Tom D, Kramer-Zucker Albrecht, Mehls Otto, Melk Anette, Querfeld Uwe, Furth Susan L, Warady Bradley A, Schaefer Franz, Köttgen Anna Nephrol Dial Transplant IF: 8.3 2016-10-18
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