SCRIB (scribble planar cell polarity protein)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCRIB
locus group:
protein-coding gene
location:
8q24.3
gene_family:
alias symbol:
KIAA0147|SCRB1|Vartul
alias name:
None
entrez id:
23513
ensembl gene id:
ENSG00000180900
ucsc gene id:
uc003yzo.1
refseq accession:
NM_015356
hgnc_id:
HGNC:30377
approved reserved:
2004-05-21

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.3

基因简述

基因简述

SCRIB基因（也称为Scribble或hScrib）属于Scribble极性复合体基因家族，该家族还包括DLG1和LLGL1等成员，共同参与细胞极性建立、细胞粘附和迁移等过程。SCRIB编码的蛋白质是一种支架蛋白，主要位于细胞膜或细胞连接处（如紧密连接和粘附连接），通过与多种信号分子（如Rac1、ERK和PI3K等）相互作用来调控细胞极性和增殖。SCRIB在维持上皮细胞极性、神经元迁移和免疫细胞功能中发挥关键作用。突变或表达异常会导致其功能丧失，破坏细胞极性并促进肿瘤发生，与乳腺癌、肺癌和结肠癌等多种癌症密切相关。SCRIB突变还与神经发育障碍（如神经管缺陷）和精神疾病（如精神分裂症）有关。SCRIB过表达通常抑制肿瘤生长，因为它能维持细胞极性并抑制异常增殖信号通路（如MAPK和Akt通路）。相反，SCRIB表达降低会破坏细胞极性，促进上皮-间质转化（EMT），增强癌细胞迁移和侵袭能力，同时可能影响其他极性蛋白（如PAR3和PKCζ）的定位和功能。SCRIB还与病毒感染有关，某些病毒（如HPV和HCV）会靶向降解SCRIB蛋白以促进自身复制。SCRIB基因家族成员的共性是均含有多个蛋白质相互作用结构域（如PDZ、LRR和LAPSD等），通过这些结构域参与细胞信号转导、膜蛋白定位和细胞骨架重排。该家族在进化上高度保守，从果蝇到人类均存在同源基因，突显其在发育和疾病中的核心作用。

中文English

这个基因编码被识别为类似于果蝇手写蛋白的蛋白质。哺乳动物蛋白是参与肿瘤抑制途径。作为参与细胞极化过程的支架蛋白，这种蛋白结合至许多其他蛋白质。所编码的蛋白质结合通过其PDZ结构域和E6的C-末端至乳头瘤病毒E6蛋白。两个编码不同的蛋白质亚型选择性剪接转录变异体也发现了这种基因。 [由RefSeq的，2011年11月提供]

OMIM数据库中对SCRIB基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCRIB基因的介绍

基因序列

基因序列

SCRIB基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MLKCIPLWRC NRHVESVDKR HCSLQAVPEE IYRYSRSLEE
41LLLDANQLRE LPKPFFRLLN LRKLGLSDNE IQRLPPEVAN
81 FMQLVELDV SRNDIPEIPE SIKFCKALEI ADFSGNPLSR
121LPDGFTQLRS LAHLALNDVS LQALPGDVGN LANLVTLELR
161E NLLKSLPA SLSFLVKLEQ LDLGGNDLEV LPDTLGALPN
201LRELWLDRNQ LSALPPELGN LRRLVCLDVS ENRLEELPAE
241LG GLVLLTD LLLSQNLLRR LPDGIGQLKQ LSILKVDQNR
281LCEVTEAIGD CENLSELILT ENLLMALPRS LGKLTKLTNL
321NVD RNHLEA LPPEIGGCVA LSVLSLRDNR LAVLPPELAH
361TTELHVLDVA GNRLQSLPFA LTHLNLKALW LAENQAQPML
401RFQT EDDAR TGEKVLTCYL LPQQPPPSLE DAGQQGSLSE
441TWSDAPPSRV SVIQFLEAPI GDEDAEEAAA EKRGLQRRAT
481PHPSE LKVM KRSIEGRRSE ACPCQPDSGS PLPAEEEKRL
521SAESGLSEDS RPSASTVSEA EPEGPSAEAQ GGSQQEATTA
561GGEEDA EED YQEPTVHFAE DALLPGDDRE IEEGQPEAPW
601TLPGGRQRLI RKDTPHYKKH FKISKLPQPE AVVALLQGMQ
641PDGEGPV AP GGWHNGPHAP WAPRAQKEEE EEEEGSPQEE
681EVEEEEENRA EEEEASTEEE DKEGAVVSAP SVKGVSFDQA
721NNLLIEPA R IEEEELTLTI LRQTGGLGIS IAGGKGSTPY
761KGDDEGIFIS RVSEEGPAAR AGVRVGDKLL EVNGVALQGA
801EHHEAVEAL RGAGTAVQMR VWRERMVEPE NAVTITPLRP
841EDDYSPRERR GGGLRLPLLP PESPGPLRQR HVACLARSER
881GLGFSIAGGK GSTPYRAGD AGIFVSRIAE GGAAHRAGTL
921QVGDRVLSIN GVDVTEARHD HAVSLLTAAS PTIALLLERE
961AGGPLPPSPL P HSSPPTAA VATTSITTAT PGVPGLPSLA
1001PSLLAAALEG PYPVEEIRLP RAGGPLGLSI VGGSDHSSHP
1041FGVQEPGVFI SK VLPRGLA ARSGLRVGDR ILAVNGQDVR
1081DATHQEAVSA LLRPCLELSL LVRRDPAPPG LRELCIQKAP
1121GERLGISIRG GAR GHAGNP RDPTDEGIFI SKVSPTGAAG
1161RDGRLRVGLR LLEVNQQSLL GLTHGEAVQL LRSVGDTLTV
1201LVCDGFEAST DAAL EVSPG VIANPFAAGI GHRNSLESIS
1241SIDRELSPEG PGKEKELPGQ TLHWGPEATE AAGRGLQPLK
1281LDYRALAAVP SAGSV QRVP SGAAGGKMAE SPCSPSGQQP
1321PSPPSPDELP ANVKQAYRAF AAVPTSHPPE DAPAQPPTPG
1361PAASPEQLSF RERQKY FEL EVRVPQAEGP PKRVSLVGAD
1401DLRKMQEEEA RKLQQKRAQM LREAAEAGAE ARLALDGETL
1441GEEEQEDEQP PWASPSP TS RQSPASPPPL GGGAPVRTAK
1481AERRHQERLR VQSPEPPAPE RALSPAELRA LEAEKRALWR
1521AARMKSLEQD ALRAQMVL S RSQEGRGTRG PLERLAEAPS
1561PAPTPSPTPV EDLGPQTSTS PGRLSPDFAE ELRSLEPSPS
1601PGPQEEDGEV ALVLLGRPS PGAVGPEDVA LCSSRRPVRP
1641GRRGLGPVPS
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q14160），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

SCRIB基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs28473203       rs28473203       rs79403624       rs79403624       rs112394497       rs112394497       rs116704662       rs116704662       rs117660037       rs117660037       rs145057333       rs145057333       rs147586124       rs147586124       rs180997235       rs180997235       rs184864560      

基因表达

基因表达

SCRIB基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATAGTCAGGTACCGTCTGGA
59
CAAAGTACTTCTGCCGCTC
59
CAGGGCTGAAGAGGAAGAG
60
CGACACTCCCTTGACAGAG
60
CTGACCCTCACTATCCTGC
59
AGATGAATATGCCCTCGTCG
59
TGTTCATCTCCAAGGTGCT
59
CACTGACTGCTTCTTGGTG
59
TATGACATCCAGTCACCGG
59
GAGCCACTTCTCCATCCTC
60
CTTTGCTGAGGAGTTGAGG
58
CCACTTCTCCATCCTCCTC
59
GGAGGAACAGGAGGATGAG
59
AATGACTTCATCCTGGCTG
58
CAGGGCTGAAGAGGAAGAG
60
CGACACTCCCTTGACAGAG
60
CTCTGTCAAGCTGACCCTC
60
CCTTATAGGGTGTGGAGCC
59
CTGAAGAGGAAGAGGCCAG
60
CAAACGACACTCCCTTGAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SCRIB基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCRIB基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001843
Q14160 (UniProtKB)
IMP
GO:0001921
Q14160 (UniProtKB)
IMP
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
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Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
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Q14160 (UniProtKB)
IPI
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Q14160 (UniProtKB)
IPI
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Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
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Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14160 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0005911
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0005913
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0008105
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0008283
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0016032
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0016080
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0016323
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0016337
Q14160 (UniProtKB)
IGI
GO:0016477
Q14160 (UniProtKB)
IMP
GO:0021747
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0030027
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0030054
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0034750
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0035089
Q14160 (UniProtKB)
IMP
GO:0035748
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0042060
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0043065
Q14160 (UniProtKB)
IMP
GO:0043615
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0045930
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0048488
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0050918
Q14160 (UniProtKB)
IMP
GO:0060088
Q14160 (UniProtKB)
IEA
GO:0060561
Q14160 (UniProtKB)
IMP
GO:0060603
Q14160 (UniProtKB)
ISS
GO:0070062
Q14160 (UniProtKB)
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GO:0071896
Q14160 (UniProtKB)
IMP
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Q14160 (UniProtKB)
IMP
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GO:0031252
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0042734
Q14160 (UniProtKB)
IDA
GO:0045211
Q14160 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCRIB基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
BioGrid
IntAct
mentha
MINT
Reactome
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
NEURAL TUBE DEFECTS, SUSCEPTIBILITY TO 0.12 1 0 UNIPROT
Adenomatous Polyposis Coli 0.00272435 1 0 LHGDN
Colonic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Mammary Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Papilloma 0.00272435 1 0 LHGDN
Disease Progression 0.00272435 1 0 LHGDN
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Craniorachischisis 0.000542884 2 0 BeFree

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