SNORD3A (small nucleolar RNA, C/D box 3A)

symbol:
SNORD3A
locus group:
non-coding RNA
location:
17p11.2
gene_family:
alias symbol:
U3|RNU3
alias name:
U3 snoRNA A|U3 small nucleolar R...
entrez id:
780851
ensembl gene id:
ENSG00000263934
ucsc gene id:
uc021trx.2
refseq accession:
NR_006880
hgnc_id:
HGNC:33189
approved reserved:
2006-11-28
17p11.2

SNORD3A(Small Nucleolar RNA, C/D Box 3A)属于小核仁RNA(snoRNA)家族中的C/D box snoRNA亚家族。这类RNA分子通常位于细胞核仁中,主要功能是通过指导核糖体RNA(rRNA)的2'-O-甲基化修饰来调控核糖体的生物合成,从而影响蛋白质翻译的效率和准确性。SNORD3A特异地靶向18S rRNA的特定位点进行甲基化修饰,这一过程对维持核糖体结构和功能至关重要。C/D box snoRNA家族的共性在于它们都含有保守的C(RUGAUGA)和D(CUGA)序列 motif,并通常与核心蛋白质如fibrillarin、NOP56、NOP58和15.5kDa蛋白形成复合物,共同完成对rRNA的修饰。SNORD3A的突变或表达异常可能破坏rRNA的正常甲基化模式,导致核糖体功能缺陷,进而影响细胞增殖、分化等基本生命活动。研究表明,SNORD3A的异常表达与某些癌症(如乳腺癌和肝癌)的发生发展相关,其过表达可能通过增强蛋白质合成促进肿瘤细胞生长,而表达降低则可能抑制核糖体功能,导致细胞周期阻滞或凋亡。此外,SNORD3A还可能通过影响其他snoRNA或mRNA的稳定性间接调控基因表达网络。需要注意的是,snoRNA通常由宿主基因的内含子编码,SNORD3A位于RPL3基因的内含子区域,因此其表达可能受到宿主基因调控机制的共同影响。

中文English

U3 RNA,丰富的核仁小分子RNA(的snoRNA),被认为在核糖体RNA前体处理的作用(伯恩斯坦等人,1983年[考研6186397]。)[由OMIM,2009年6月提供。

SNORD3A基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
SNORD3A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs72639203       rs111391809       rs190586226       rs199585448       rs199662490       rs199724492       rs199736881       rs199861716       rs199931040       rs200026453       rs200120495       rs200234160       rs200392693       rs200422459       rs200463907       rs200483586       rs200526694      

SNORD3A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTCTTGTTCTGTCTGCCG
60
GAGGCAGATGTTGCTAGGA
59
CTCTGAACGTGTAGAGCAC
58
GATCATCAATGGCTGACGG
59
CTCTGAACGTGTAGAGCAC
58
GATCATCAATGGCTGACGG
59
GTCTCTTGTTCTGTCTGCC
58
AGGCAGATGTTGCTAGGAG
59
TCTGAACGTGTAGAGCACC
60
CGATCATCAATGGCTGACG
59
TCTGAACGTGTAGAGCACC
60
CGATCATCAATGGCTGACG
59
TCTCTTGTTCTGTCTGCCG
60
AGGCAGATGTTGCTAGGAG
59
TCTGAACGTGTAGAGCACC
60
GATCATCAATGGCTGACGG
59
TCTGAACGTGTAGAGCACC
60
GATCATCAATGGCTGACGG
59
      尚未收录相关数据

SNORD3A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNORD3A基因的本体(GO)信息:

可能调控 SNORD3A基因的相关microRNA:     

BioGrid
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Creutzfeldt-Jakob disease 0.12 1 0 CTD_human
Prion Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Transcriptomic Traces of Noise Exposure in Hearing Loss and Systematic Identification of Biomarker Candidates at the Molecular Scale.
Öztan G, İşsever H, Güldiken Y, Canbaz S, Oğuz F, Kurt ÖK, İşsever T Int J Mol Sci IF: 3.226 2026-05-08
Snord 3A: a molecular marker and modulator of prion disease progression.
Cohen Eran, Avrahami Dana, Frid Kati, Canello Tamar, Levy Lahad Ephrat, Zeligson Sharon, Perlberg Shira, Chapman Joab, Cohen Oren S, Kahana Esther, Lavon Iris, Gabizon Ruth PLoS One IF: 2.6 2013-07-19

评论加载中...

登录后即可发表评论 登录 注册

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: [email protected]