SOX21-AS1 (SOX21 antisense divergent transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SOX21-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
13q32.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100507533
ensembl gene id:
ENSG00000227640
ucsc gene id:
uc001vmb.3
refseq accession:
NR_046514
hgnc_id:
HGNC:39807
approved reserved:
2011-03-29

基因染色体位置

基因染色体位置

13q32.1

基因简述

基因简述

SOX21-AS1是一种长链非编码RNA（lncRNA），位于人类染色体13q32.1区域，与SOX21基因相邻且反义转录。它属于SOX基因家族相关的非编码RNA，SOX家族是一类编码转录因子的基因，以其SRY相关HMG盒（SOX）结构域为特征，参与胚胎发育、细胞命运决定和组织分化等关键生物学过程。SOX21-AS1虽不编码蛋白质，但通过调控邻近基因SOX21或其他靶基因的表达来发挥作用。研究表明，SOX21-AS1在神经发育中可能具有调控作用，影响神经干细胞的增殖与分化。其突变或表达异常可能与神经系统疾病或肿瘤发生相关，例如在胶质瘤中观察到SOX21-AS1的异常表达，提示其可能通过表观遗传修饰或竞争性内源RNA（ceRNA）机制参与肿瘤进展。当SOX21-AS1过表达时，可能抑制SOX21或其他关键基因的功能，导致细胞分化受阻或增殖失控；而降低表达则可能解除这种抑制，但具体效应因组织环境而异。该基因与SOX家族其他成员（如SOX2、SOX9）共享调控发育的共性，但作为非编码RNA，其作用更侧重于转录后调控而非直接参与DNA结合。目前研究仍在探索其精确机制及与疾病的关联，尤其在神经退行性疾病和癌症中的潜在诊断或治疗价值。

中文English

无

OMIM数据库中对SOX21-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SOX21-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

SOX21-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

SOX21-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1555571       rs2253604       rs7982376       rs7982791       rs7997067       rs7998562       rs9301991       rs9561672       rs10083221       rs10083267       rs11617760       rs41277656       rs56009025       rs61090007       rs61966960       rs111321506       rs112443365      

基因表达

基因表达

SOX21-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTTTAGGCGAGTGGAGAG
59
GAGAGGCTCTCCTACTCGT
59
TGCTGCAGGAGAGTTAAGG
59
CTCTCCACTCGCCTAAACC
59
GCTGCAGGAGAGTTAAGGA
59
CTCTCCACTCGCCTAAACC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SOX21-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SOX21-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SOX21-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关文献

基因相关文献

LncRNA SOX21-AS1 is associated with poor prognosis and immunomodulation in glioblastoma.
Yang Y, Sun J, Fang Y, Shan W, Li P, Ma Y, Ni W Transl Cancer Res IF: 2.1 2026-05-30
Aberrant DNA hypermethylation-silenced SOX21-AS1 gene expression and its clinical importance in oral cancer.
Yang Cheng-Mei, Wang Tsung-Han, Chen Hung-Chih, Li Sung-Chou, Lee Ming-Chien, Liou Huei-Han, Liu Pei-Feng, Tseng Yu-Kai, Shiue Yow-Ling, Ger Luo-Ping, Tsai Kuo-Wang Clin Epigenetics IF: 5.7 0000-00-00

基因相关服务

基因相关服务

基因相关评论

基因相关评论

评论加载中...

登录后即可发表评论 登录 注册

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: [email protected]

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备20007159号-2