SYF2P2 (SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 2)

基因基本信息

基因基本信息

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SYF2P2
locus group:
pseudogene
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9p13.3
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NG_021644
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HGNC:38139
approved reserved:
2010-04-20

基因染色体位置

基因染色体位置

9p13.3

基因简述

基因简述

SYF2P2（也称为SYF2假基因2）是一个假基因，属于SYF2基因家族。假基因通常是由功能基因复制或逆转录转座产生的非功能性DNA序列，由于突变积累而失去编码蛋白质的能力。SYF2基因家族的成员主要参与RNA剪接和细胞周期调控，其功能基因SYF2（也称为XAB2复合体成员）在pre-mRNA剪接和DNA修复中起重要作用。SYF2P2作为假基因，目前尚未发现其具有明确的生物学功能或表达产物，但假基因有时可能通过调控邻近基因的表达或作为竞争性内源RNA（ceRNA）影响细胞过程。由于SYF2P2是假基因，其突变通常不会对机体产生直接影响，但假基因的异常表达或结构变化可能干扰功能基因的调控网络。SYF2P2的过表达或降低表达对机体的影响尚不明确，但假基因的异常表达有时会通过竞争miRNA结合位点或转录因子结合位点影响相关功能基因的表达水平。SYF2基因家族的共性包括参与RNA代谢和维持基因组稳定性，其成员通常与剪接体和DNA损伤修复复合物相互作用。SYF2P2与疾病的关系尚未有明确报道，但假基因的异常调控可能与某些癌症或遗传性疾病相关，这需要进一步研究验证。

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无

OMIM数据库中对SYF2P2基因的介绍     Wikipedia数据库中对SYF2P2基因的介绍

基因序列

基因序列

SYF2P2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SYF2P2基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

SYF2P2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCACTCAGAAGCATGAACC
59
TCAGTCTCTTTCAGGTGCAG
60
TTACATTATGCCACTTCCCAG
58
CAGGTTTGATCTGCTTGGTC
59
TTTACATTATGCCACTTCCCAG
59
AGGTTTGATCTGCTTGGTC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SYF2P2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SYF2P2基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SYF2P2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

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基因通路

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