TESC-AS1 (TESC antisense RNA 1 (head to head))

symbol:
TESC-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
12q24.22
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
101928244
ensembl gene id:
ENSG00000258285
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refseq accession:
NR_120464
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HGNC:51142
approved reserved:
2014-07-30
12q24.22

TESC-AS1是一种长链非编码RNA(lncRNA),属于长链非编码RNA基因家族的一员。这个基因家族的特点是转录本长度超过200个核苷酸,但不编码蛋白质,而是通过调控其他基因的表达来发挥生物学功能。TESC-AS1位于人类染色体12q24.31区域,与邻近的TESC基因存在反义重叠关系,可能在转录水平上调控TESC的表达。TESC-AS1在多种组织中表达,但其表达水平相对较低,研究显示它在胚胎发育和细胞分化过程中可能发挥重要作用。目前关于TESC-AS1的具体功能机制尚不完全清楚,但已有研究表明它可能参与调控细胞增殖、分化和凋亡等过程。在某些癌症如肝细胞癌和结直肠癌中,TESC-AS1的表达水平发生异常,提示它可能与肿瘤发生发展相关。当TESC-AS1过表达时,可能通过调控下游靶基因促进肿瘤细胞的增殖和转移;而降低表达则可能抑制这些恶性表型。TESC-AS1的突变或表达异常可能影响其调控网络,导致相关信号通路失调,进而影响细胞稳态。由于lncRNA通常具有组织特异性表达模式,TESC-AS1在不同组织或疾病状态下的功能可能存在差异。作为lncRNA基因家族成员,TESC-AS1与其他家族成员一样,主要通过RNA-RNA、RNA-DNA或RNA-蛋白质相互作用来调控基因表达。随着对非编码RNA研究的深入,TESC-AS1的具体功能机制及其在疾病中的作用将被进一步阐明。

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TESC-AS1基因的碱基序列:[NCBI]
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TESC-AS1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs904660       rs1316314       rs1344402       rs1344403       rs1875141       rs2088700       rs2133679       rs2893704       rs2893705       rs3862136       rs3935912       rs3935913       rs4271458       rs4379913       rs5801211       rs7297162       rs7300649      

TESC-AS1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCAAGGCTCTCCTGAAGG
60
GGTGCCAAATGGTTTCCTG
60
ATCAAGGTCAAGGCTCTCC
59
AAATGGTTTCCTGATACCTGAC
59
CATCAAGGTCAAGGCTCTC
58
AATGGTTTCCTGATACCTGAC
58
      尚未收录相关数据

TESC-AS1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TESC-AS1基因的本体(GO)信息:

可能调控 TESC-AS1基因的相关microRNA:     

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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