TRIM13 (tripartite motif containing 13)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRIM13
locus group:
protein-coding gene
location:
13q14.2
gene_family:
Ring finger proteins|Tripartite motif-containing
alias symbol:
Leu5|RNF77|DLEU5
alias name:
None
entrez id:
10206
ensembl gene id:
ENSG00000204977
ucsc gene id:
uc001vds.2
refseq accession:
NM_001007278
hgnc_id:
HGNC:9976
approved reserved:
1999-12-01

基因染色体位置

基因染色体位置

13q14.2

基因简述

基因简述

TRIM13（Tripartite Motif Containing 13）属于TRIM基因家族，这是一个以含有RING结构域、B-box和卷曲螺旋结构域为共同特征的蛋白质家族，主要参与泛素化、先天免疫、细胞增殖和凋亡等过程。TRIM13定位于13号染色体，编码一种E3泛素连接酶，通过泛素-蛋白酶体系统调控蛋白质降解，影响细胞周期、DNA损伤修复和自噬等关键生物学功能。其表达产物在多种组织中存在，尤其在免疫系统中发挥重要作用，如参与内质网应激反应和病毒防御。TRIM13通过与其他蛋白（如p53和MDM2）相互作用调节细胞凋亡，抑制肿瘤生长。突变可能导致其泛素化功能异常，与某些癌症（如多发性骨髓瘤和淋巴瘤）的发生发展相关，也可能影响免疫系统功能。若TRIM13过表达，可能增强抑癌作用，促进异常细胞清除，但过度激活可能引发非特异性炎症或自噬过度；若表达降低，则可能削弱肿瘤抑制功能，增加基因组不稳定性或病毒易感性。TRIM家族成员均具有保守的N端TRIM结构域，但C端差异赋予各自特异性功能，如TRIM5α抗病毒、TRIM28表观调控等。研究TRIM13有助于理解癌症、免疫疾病及感染性疾病的机制，并为靶向治疗提供潜在分子标记。

中文English

该基因编码的三方母题（TRIM）家族中的一员。 TRIM的基序包括三个锌结合结构域，一个环，B框型1和B框2型，和一个卷曲螺旋区域。这个基因位于B细胞慢性淋巴细胞白血病的最小缺失区域内13号染色体。多重选择性剪接转录变异体也发现了这种基因。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对TRIM13基因的介绍     Wikipedia数据库中对TRIM13基因的介绍

基因序列

基因序列

TRIM13基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MELLEEDLTC PICCSLFDDP RVLPCSHNFC KKCLEGILEG
41SVRNSLWRPA PFKCPTCRKE TSATGINSLQ VNYSLKGIVE
81 KYNKIKISP KMPVCKGHLG QPLNIFCLTD MQLICGICAT
121RGEHTKHVFC SIEDAYAQER DAFESLFQSF ETWRRGDALS
161R LDTLETSK RKSLQLLTKD SDKVKEFFEK LQHTLDQKKN
201EILSDFETMK LAVMQAYDPE INKLNTILQE QRMAFNIAEA
241FK DVSEPIV FLQQMQEFRE KIKVIKETPL PPSNLPASPL
281MKNFDTSQWE DIKLVDVDKL SLPQDTGTFI SKIPWSFYKL
321FLL ILLLGL VIVFGPTMFL EWSLFDDLAT WKGCLSNFSS
361YLTKTADFIE QSVFYWEQVT DGFFIFNERF KNFTLVVLNN
401VAEF VCKYK LL
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: O60858），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

TRIM13基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs15536       rs1043208       rs1056543       rs2066540       rs2066541       rs2066544       rs2066545       rs2066546       rs2066547       rs2066548       rs2066549       rs2066550       rs2066552       rs2472597       rs2476389       rs2490636       rs2740543      

基因表达

基因表达

TRIM13基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAGACAGAGAATAACAGCAC
59
CTTCAAGCAGCTCCATCAC
59
GTAGCCTCTAGTTCGTTAGTC
58
TAGAAACATACCTCTGTCTCCT
58
GAGACAGAGGATGTGATGGA
59
TTTGCAGAAGTTGTGGGAG
58
AGACAGAGGATGTGATGGAG
59
TTTGCAGAAGTTGTGGGAG
58
GAGACAGAGAATAACAGCACC
59
CTTCAAGCAGCTCCATCAC
59
AGTAGCCTCTAGTTCGTTAGTC
59
AGAAACATACCTCTGTCTCCT
58
GTAGCCTCTAGTTCGTTAGTC
58
AGAAACATACCTCTGTCTCCT
58
AGACAGAGGATGTGATGGA
57
TTTGCAGAAGTTGTGGGAG
58
AGACAGAGAATAACAGCACCT
59
CTTCAAGCAGCTCCATCAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TRIM13基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRIM13基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004842
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0004871
O60858 (UniProtKB)
IMP
GO:0005515
O60858 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60858 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60858 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60858 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60858 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0005789
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0007165
O60858 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
O60858 (UniProtKB)
IEA
GO:0009653
O60858 (UniProtKB)
TAS
GO:0010332
O60858 (UniProtKB)
IEP
GO:0010942
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
O60858 (UniProtKB)
IEA
GO:0016239
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0016874
O60858 (UniProtKB)
IEA
GO:0030433
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0032897
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0043123
O60858 (UniProtKB)
IMP
GO:0043123
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0043161
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0045087
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0051092
O60858 (UniProtKB)
IMP
GO:0051865
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0097038
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0097038
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:1902187
O60858 (UniProtKB)
IDA
GO:0005622
X6R9U5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
X6R9U5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
X6RH27 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
X6RH27 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRIM13基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid
IntAct
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
leukemia 0.002171535 8 0 BeFree
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.001628651 6 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.001357209 5 0 BeFree
Liver carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Solid tumour 0.001085767 4 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree

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