ZSCAN2 (zinc finger and SCAN domain containing 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ZSCAN2
locus group:
protein-coding gene
location:
15q25.2
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type
alias symbol:
FLJ20595|ZNF854
alias name:
None
entrez id:
54993
ensembl gene id:
ENSG00000176371
ucsc gene id:
uc059mrt.1
refseq accession:
NM_017894
hgnc_id:
HGNC:20994
approved reserved:
2003-04-30

基因染色体位置

基因染色体位置

15q25.2

基因简述

基因简述

ZSCAN2（Zinc Finger and SCAN Domain Containing 2）属于SCAN-ZNF（SCAN锌指蛋白）基因家族，该家族成员通常含有SCAN结构域和多个C2H2型锌指结构域，主要参与转录调控。ZSCAN2编码的蛋白质通过其锌指结构域与DNA结合，调控下游靶基因的表达，可能在细胞分化、发育及肿瘤发生中发挥作用。SCAN-ZNF家族的共性包括参与表观遗传调控、染色质重塑及基因沉默等过程，尤其在胚胎发育和干细胞维持中具有重要功能。ZSCAN2的表达产物可能通过与其他转录因子或共调节因子相互作用，影响细胞增殖或分化相关通路。若ZSCAN2发生功能丧失性突变，可能导致其靶基因表达失调，进而影响正常发育或增加疾病风险；而某些突变可能破坏其DNA结合能力，导致转录调控异常。研究表明，ZSCAN2可能与某些癌症（如肝癌或乳腺癌）相关，其异常表达可能促进肿瘤细胞增殖或转移。当ZSCAN2过表达时，可能过度抑制或激活下游基因，扰乱细胞周期或凋亡过程；若表达降低，则可能导致其调控的促分化或抑癌基因功能减弱，增加细胞恶性转化的风险。此外，ZSCAN2可能参与免疫调节，其表达变化可能影响炎症相关信号通路。目前对该基因的研究仍在深入，其在疾病中的具体机制及潜在治疗价值需进一步探索。

中文English

由该基因编码的蛋白质含有锌指结构，这是常见的转录调控蛋白质中的多个副本。在小鼠中的研究表明，在胚胎发育过程中该基因表达，特别是在成年小鼠睾丸，表明它可能在调控生殖细胞的基因发挥作用。在几个转录本基因导致选择性剪接变异体编码不同亚型。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对ZSCAN2基因的介绍     Wikipedia数据库中对ZSCAN2基因的介绍

基因序列

基因序列

ZSCAN2基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MMAADIPRVT TPLSSLVQVP QEEDRQEEEV TTMILEDDSW
41VQEAVLQEDG PESEPFPQSA GKGGPQEEVT RGPQGALGRL
81 RELCRRWLR PEVHTKEQML TMLPKEIQAW LQEHRPESSE
121EAAALVEDLT QTLQDSDFEI QSENGENCNQ DMFENESRKI
161F SEMPEGES AQHSDGESDF ERDAGIQRLQ GHSPGEDHGE
201VVSQDREVGQ LIGLQGTYLG EKPYECPQCG KTFSRKSHLI
241TH ERTHTGE KYYKCDECGK SFSDGSNFSR HQTTHTGEKP
281YKCRDCGKSF SRSANLITHQ RIHTGEKPFQ CAECGKSFSR
321SPN LIAHQR THTGEKPYSC PECGKSFGNR SSLNTHQGIH
361TGEKPYECKE CGESFSYNSN LIRHQRIHTG EKPYKCTDCG
401QRFS QSSAL ITHRRTHTGE KPYQCSECGK SFSRSSNLAT
441HRRTHMVEKP YKCGVCGKSF SQSSSLIAHQ GMHTGEKPYE
481CLTCG ESFS WSSNLLKHQR IHTGEKPYKC SECGKCFSQR
521SQLVVHQRTH TGEKPYKCLM CGKSFSRGSI LVMHQRAHLG
561DKPYRC PEC GKGFSWNSVL IIHQRIHTGE KPYKCPECGK
601GFSNSSNFIT HQRTHMKEKL Y
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q7Z7L9），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

ZSCAN2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs167445       rs172634       rs309426       rs748455       rs2271433       rs2271434       rs2341185       rs2879970       rs3817193       rs3827937       rs4842975       rs6496164       rs7169769       rs7180895       rs7181779       rs8023995       rs10083683      

基因表达

基因表达

ZSCAN2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAAATTCAGGCTTGGCTG
59
AATCACTGTCCTGAAGGGT
58
AAGGAAATTCAGGCTTGGC
58
AAGCTGTTTCACTGTCCTG
58
TCTCCCGTCCATTGTTCTC
59
ATCAACAAGTAGTCCCGAGC
59
GGAAATTCAGGCTTGGCTG
59
AATTGTCCTGAAGGGTCTGG
59
TCTCCCGTCCATTGTTCTC
59
ATCAACAAGTAGTCCCGCTC
59
AACTCCAATCTAATCAGACACC
58
CGGTACATTTGTAGGGTTTCTC
59
TTCAGGACAGTGCTGTAGC
59
CCATAGTATCTGACTGGAGATCC
59
TTGAGACGGAGTCTCACTC
58
TCCCAAAGAGTTAGGATTATAGGC
59
TCTCCCGTCCATTGTTCTC
59
TCAACAAGTAGTCCCGCTC
59
TTTGAGACGGAGTCTCACTC
59
CCCAAAGAGTTAGGATTATAGGC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ZSCAN2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZSCAN2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
A0A0C4DFQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
A0A0C4DFQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A0A0C4DFQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
A0A0C4DFQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A0C4DFQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
A0A0C4DFQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
F5GY18 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
F5GY18 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
F5GZ04 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
F5GZ04 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
F5H3F3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
F5H3F3 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
F5H4P1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
F5H4P1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
F8W6Y9 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
F8W6Y9 (UniProtKB)
IEA
GO:0000977
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IBA
GO:0003700
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IBA
GO:0007275
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q7Z7L9 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ZSCAN2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
BioGrid
IntAct
mentha
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

基因通路

基因相关疾病

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疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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