EFHB (EF-hand domain family member B)

symbol:
EFHB
locus group:
protein-coding gene
location:
3p24.3
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
FLJ25200|CFAP21
alias name:
cilia and flagella associated pr...
entrez id:
151651
ensembl gene id:
ENSG00000163576
ucsc gene id:
uc003cbl.5
refseq accession:
NM_144715
hgnc_id:
HGNC:26330
approved reserved:
2005-01-25
3p24.3

EFHB(EF-hand domain family member B)是一个属于EF-hand结构域蛋白家族的基因,其编码的蛋白质含有EF-hand结构域,这是一种常见的钙离子结合模体,能够感知和传递钙信号。EFHB在多种组织中表达,尤其在神经系统和肌肉组织中较为丰富,参与调控钙依赖性信号通路,影响细胞增殖、分化和凋亡等过程。EFHB的主要作用位点包括细胞质和细胞膜,通过与钙离子结合来调节下游信号分子的活性。突变可能导致EFHB失去钙结合能力,进而影响其功能,例如干扰神经元的电活动或肌肉收缩,与某些神经系统疾病或肌肉功能障碍相关。研究表明,EFHB的异常表达可能与癫痫、阿尔茨海默病等神经退行性疾病有关。当EFHB过表达时,可能增强钙信号传导,导致细胞过度兴奋或凋亡;而降低表达则可能削弱钙信号,影响细胞正常功能。EF-hand基因家族包括许多成员,如钙调蛋白(Calmodulin)和S100蛋白等,它们共同特点是含有EF-hand结构域,能够结合钙离子并参与细胞信号转导、肌肉收缩、神经传递等生理过程。EFHB作为该家族的一员,共享这些功能特性,但可能具有组织特异性或独特的调控机制。

中文English

EFHB基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1MNMEIGHPHE GKDDLGDKRV IMGTKFPMEL GIRVGLGKED
41SRCGESPVVS NKCEGRMAPP ETKFPLSKGL EMGLERQNIS
81 RTVMQRGSL GVDSVSASQG TKPSLLPGRM GLENESLLAG
121YTHERIIQPP LGRVCGSSQA AGSRRAPLAS GPEGVEELVG
161K PAFVMEPR QEMEKESTCV LMKPNTEIKL PVEVDIGLTQ
201AEGPDETKNT EPQMGLVIEP PQCQFAQQHE QRKEAGNIES
241GV EPPDRIR PIYSGKFFDR TPCWPSAGKV IPVGYRVATC
281LTEKLPRLIT PPEAKKYFNF RYPPAGVERV FYGRANDPQI
321APY LTHGIR SKISVLANTL INPQPITTFQ QKIKDKKESI
361YLSNRRAPLG KSHDQAPGLP KGMDTTNTTF GTAVIKEYSA
401KDVV NPPKS YEEVFKEGNE GHDLYVVSHN DYYAGEAKNR
441KYNPSSFHRC SVYGVPTPHF NDGRAMAKSL YWLHELQMKR
481GAKFV SKRA DDFKEKFQHK LGRVLDPIAE TMNVPPDCTF
521GACLRPEEYG VGDLIHNRLP DEYLRGKDRQ RALIAAVRHH
561LKKVNY QKF DTLLAAFRHY DKKGDGMIDK DELQEACDQA
601NLSLDDKLLD QLFDYCDVDN DGFINYLEFA NFLNWKDKML
641LKEYEER VI IKGRKPDCVN PTEANVEEPE QTLLIKPEDI
681VLKEAGSTEK TLRTLLRPSD KVSNYYKTTS SEINAIVGAI
721PSTCYPIC G VPTIRSDIPA PRIRRISDRT NYGEEGSAYS
761LLYPTIFARK GVFERDFFKT RSKEEIAEIL CNIGVKLSDE
801EFENVWNLA SKKHHRGEVC VENIRNVLDE LRHADRIKCK
841TLM
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: Q8N7U6),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
EFHB基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs874983       rs874984       rs1133328       rs1386310       rs1386311       rs1386312       rs1872736       rs1872737       rs1906130       rs2006688       rs2087107       rs2101390       rs2170341       rs2170342       rs2171275       rs2291411       rs2306774      

EFHB基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACGGAAGAGCAAATGATCC
58
CAATGTGTTTGCCAGTACTG
58
CCAGGTAAAGAATTTGAGACAC
57
TCAGAATCCAGCTTCTGCA
59
GGAATATGGAGTTGGTGATCTC
58
CTTTCTTCAGGTGATGCCG
59
GATTATTATGCAGGAGAGGCA
58
GGTGTTGGTACTCCATACAC
58
AGGAATATGGAGTTGGTGATCTC
60
TTTCTTCAGGTGATGCCGA
59
CCCAGGTAAAGAATTTGAGACAC
60
CAGAATCCAGCTTCTGCAC
59
CCAGGTAAAGAATTTGAGACAC
57
CAGAATCCAGCTTCTGCAC
59
GGAATATGGAGTTGGTGATCTC
58
TTTCTTCAGGTGATGCCGA
59
CGGAAGAGCAAATGATCCC
59
CAATGTGTTTGCCAGTACTG
58
      尚未收录相关数据

EFHB基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

EFHB基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q8N7U6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 EFHB基因的相关microRNA:     

String
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.000271442 1 0 BeFree
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